RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.75■□□□□ 0.91
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SPNS2-208ENST00000576635 SRGNP10124 158 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS2-208ENST00000576635 ST5P78524 1137 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS2-208ENST00000576635 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
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SPNS2-208ENST00000576635 USP16Q9Y5T5 823 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS2-208ENST00000576635 STYK1Q6J9G0 422 aa20.73■□□□□ 0.91
SPNS2-208ENST00000576635 CNKSR1Q969H4 720 aa20.73■□□□□ 0.91
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SPNS2-208ENST00000576635 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
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SPNS2-208ENST00000576635 CHADLQ6NUI6 762 aa20.68■□□□□ 0.9
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SPNS2-208ENST00000576635 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.66■□□□□ 0.9
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SPNS2-208ENST00000576635 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.64■□□□□ 0.9
SPNS2-208ENST00000576635 NPR1P16066 1061 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-208ENST00000576635 PPP2R1AP30153 589 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-208ENST00000576635 CREBZFQ9NS37 354 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-208ENST00000576635 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
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SPNS2-208ENST00000576635 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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SPNS2-208ENST00000576635 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.62■□□□□ 0.89
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SPNS2-208ENST00000576635 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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SPNS2-208ENST00000576635 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-208ENST00000576635 CNTNAP1P78357 1384 aa20.58■□□□□ 0.88
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SPNS2-208ENST00000576635 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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SPNS2-208ENST00000576635 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPNS2-208ENST00000576635 NYXQ9GZU5 481 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 VEGFBP49765 207 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 PSMD1Q99460 953 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 GPTP24298 496 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 SLC51AQ86UW1 340 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 GPC2Q8N158 579 aa20.49■□□□□ 0.87
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