RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 DCAF5Q96JK2 942 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 CYP27B1O15528 508 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 SGSM2O43147 1006 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 IGKV5-2P06315 115 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 PKP1Q13835 747 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 TMX3Q96JJ7 454 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
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EHD4-202ENST00000569223 MYL6BP14649 208 aa28.18■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 HSPA4P34932 840 aa28.17■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.17■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 RAD50Q92878 1312 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.14■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 CUL4AQ13619 759 aa28.14■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 COPS6Q7L5N1 327 aa28.14■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 HSPA2P54652 639 aa28.14■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.14■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 ZDHHC9Q9Y397 364 aa28.14■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.13■■■□□ 2.09
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EHD4-202ENST00000569223 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
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EHD4-202ENST00000569223 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 USP16Q9Y5T5 823 aa28.13■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 GLI3P10071 1580 aa28.13■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.12■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 MRE11P49959 708 aa28.12■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.12■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 GCKRQ14397 625 aa28.11■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 MCTP1Q6DN14 999 aa28.11■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 AACSQ86V21 672 aa28.11■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 MYD88Q99836 296 aa28.11■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 SASH1O94885 1247 aa28.11■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 KLHL40Q2TBA0 621 aa28.1■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 BRINP3Q76B58 766 aa28.1■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 CABP4P57796 275 aa28.09■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.09■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.08■■■□□ 2.09
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EHD4-202ENST00000569223 GRPEL1Q9HAV7 217 aa28.08■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.08■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
EHD4-202ENST00000569223 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.08■■■□□ 2.08
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EHD4-202ENST00000569223 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
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EHD4-202ENST00000569223 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
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EHD4-202ENST00000569223 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.06■■■□□ 2.08
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EHD4-202ENST00000569223 EVI5LQ96CN4 794 aa28.05■■■□□ 2.08
EHD4-202ENST00000569223 SIL1Q9H173 461 aa28.04■■■□□ 2.08
EHD4-202ENST00000569223 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.04■■■□□ 2.08
EHD4-202ENST00000569223 RASEFQ8IZ41 740 aa28.03■■■□□ 2.08
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EHD4-202ENST00000569223 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.02■■■□□ 2.08
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EHD4-202ENST00000569223 ABCA3Q99758 1704 aa28■■■□□ 2.07
EHD4-202ENST00000569223 COL15A1P39059 1388 aa28■■■□□ 2.07
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EHD4-202ENST00000569223 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
EHD4-202ENST00000569223 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD4-202ENST00000569223 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
EHD4-202ENST00000569223 COPRSQ9NQ92 184 aa27.98■■■□□ 2.07
EHD4-202ENST00000569223 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
EHD4-202ENST00000569223 PAPPAQ13219 1627 aa27.97■■■□□ 2.07
EHD4-202ENST00000569223 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
EHD4-202ENST00000569223 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.97■■■□□ 2.07
EHD4-202ENST00000569223 ERBB4Q15303 1308 aa27.97■■■□□ 2.07
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