RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 SETDB2Q96T68 719 aa14.95□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.94□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.94□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 ERFEQ4G0M1 354 aa14.93□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.93□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 MASTLQ96GX5 879 aa14.93□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 PCNTO95613 3336 aa14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 NBPF26B4DH59 902 aa14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 PPP2R1AP30153 589 aa14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 ST5P78524 1137 aa14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 SOGA3Q5TF21 947 aa14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 NBPF15Q8N660 670 aa14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 CFAP53Q96M91 514 aa14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 SNED1Q8TER0 1413 aa14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 MCM10Q7L590 875 aa14.91□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 NUDCQ9Y266 331 aa14.9□□□□□ -0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 POTEIP0CG38 1075 aa14.89□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 POTEJP0CG39 1038 aa14.89□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.89□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 NPR1P16066 1061 aa14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 DCTN1Q14203 1278 aa14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 CHADLQ6NUI6 762 aa14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 TNS4Q8IZW8 715 aa14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 CACNA1SQ13698 1873 aa14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 CCDC93Q567U6 631 aa14.87□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 CREBZFQ9NS37 354 aa14.87□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.87□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 PASKQ96RG2 1323 aa14.87□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 SCN4AP35499 1836 aa14.87□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 HLFQ16534 295 aa14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 CRY2Q49AN0 593 aa14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.84□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.84□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 NPHP1O15259 732 aa14.84□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 LDHDQ86WU2 507 aa14.84□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.84□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.84□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 ABCC12Q96J65 1359 aa14.84□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 FZD9O00144 591 aa14.83□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 OLFM4Q6UX06 510 aa14.83□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.83□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 CNTNAP1P78357 1384 aa14.83□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 PSMD1Q99460 953 aa14.82□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 COL4A5P29400 1685 aa14.81□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 ALDH1B1P30837 517 aa14.81□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.81□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.81□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.81□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.8□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.8□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 NUP98P52948 1817 aa14.8□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.79□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 SYNE4Q8N205 404 aa14.79□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 NYXQ9GZU5 481 aa14.79□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 ERBB4Q15303 1308 aa14.78□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 EPHX2P34913 555 aa14.78□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 NFE2L2Q16236 605 aa14.78□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.78□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.78□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 GPC2Q8N158 579 aa14.78□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 HACL1Q9UJ83 578 aa14.78□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.77□□□□□ -0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM177BA6PVY3 158 aa14.77□□□□□ -0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.77□□□□□ -0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 LTBP1Q14766 1721 aa14.77□□□□□ -0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.76□□□□□ -0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 NTSR2O95665 410 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms