RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567843.1

GTF3C1-208, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C1, Length 474 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-208ENST00000567843 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1-208ENST00000567843 ST5P78524 1137 aa16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1-208ENST00000567843 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1-208ENST00000567843 TTLL7Q6ZT98 887 aa16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1-208ENST00000567843 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1-208ENST00000567843 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 CLEC4GQ6UXB4 293 aa16.08■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 NFKBIEO00221 500 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 ANXA1P04083 346 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 NECTIN2Q92692 538 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 RRAGCQ9HB90 399 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.06■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 LMNB1P20700 586 aa16.06■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 GPTP24298 496 aa16.06■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.06■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 SRGNP10124 158 aa16.05■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 KRT24Q2M2I5 525 aa16.05■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 TPTE2Q6XPS3 522 aa16.05■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 HSPA6P17066 643 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 CNKSR1Q969H4 720 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 RUNDC1Q96C34 613 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 MASTLQ96GX5 879 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 BCORQ6W2J9 1755 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 TOMM70O94826 608 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 PROSER3Q2NL68 480 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 STYK1Q6J9G0 422 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 OLFM4Q6UX06 510 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 CEP350Q5VT06 3117 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
GTF3C1-208ENST00000567843 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.02■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 ERVV-1B6SEH8 477 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 PDIA6Q15084 440 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 ERFEQ4G0M1 354 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 ZNF428Q96B54 188 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 SBF1O95248 1867 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 ABCC12Q96J65 1359 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 NPR1P16066 1061 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 SUSD4Q5VX71 490 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 TAOK3Q9H2K8 898 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 SLX4Q8IY92 1834 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 LAMB4A4D0S4 1761 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 GLTPD2A6NH11 291 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 CHL1O00533 1208 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 APAF1O14727 1248 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 RGL2O15211 777 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 ERBB4Q15303 1308 aa15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 HTRA3P83110 453 aa15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 CCDC184Q52MB2 194 aa15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 COPS6Q7L5N1 327 aa15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 SLC51AQ86UW1 340 aa15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 NYXQ9GZU5 481 aa15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.97■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 CCDC93Q567U6 631 aa15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1-208ENST00000567843 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 CACNA1SQ13698 1873 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 NTSR2O95665 410 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 ALDH1B1P30837 517 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 SOGA3Q5TF21 947 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 NUP98P52948 1817 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 LTBP3Q9NS15 1303 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 POTECB2RU33 542 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 APLP1P51693 650 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 SYNE4Q8N205 404 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1-208ENST00000567843 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms