RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDE6BP35913 854 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 TOMM70O94826 608 aa9.47□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYL6BP14649 208 aa9.47□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.47□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SLX4Q8IY92 1834 aa9.47□□□□□ -0.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.47□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RALBP1Q15311 655 aa9.46□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEUROD2Q15784 382 aa9.46□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 HLFQ16534 295 aa9.46□□□□□ -0.9
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CCNDBP1-212ENST00000567690 HTRA3P83110 453 aa9.45□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 OLFM4Q6UX06 510 aa9.45□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.45□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPYL4Q9UJ04 414 aa9.45□□□□□ -0.9
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ABCC12Q96J65 1359 aa9.45□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 WDR90Q96KV7 1748 aa9.45□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.45□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANXA1P04083 346 aa9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRGNP10124 158 aa9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 STYK1Q6J9G0 422 aa9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 NECTIN2Q92692 538 aa9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNKSR1Q969H4 720 aa9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 MASTLQ96GX5 879 aa9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAOK3Q9H2K8 898 aa9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUP98P52948 1817 aa9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 APLP1P51693 650 aa9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERFEQ4G0M1 354 aa9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLTPD2A6NH11 291 aa9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPR1P16066 1061 aa9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT24Q2M2I5 525 aa9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 PROSER3Q2NL68 480 aa9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC51AQ86UW1 340 aa9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.41□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC93Q567U6 631 aa9.41□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF428Q96B54 188 aa9.41□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDNO94850 711 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 FSTL1Q12841 308 aa9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 SOGA3Q5TF21 947 aa9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 SUSD4Q5VX71 490 aa9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMC1BQ8NDV3 1235 aa9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 NYXQ9GZU5 481 aa9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERBB4Q15303 1308 aa9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 POTECB2RU33 542 aa9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVV-1B6SEH8 477 aa9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 RGL2O15211 777 aa9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 NTSR2O95665 410 aa9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDIA6Q15084 440 aa9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 RUNDC1Q96C34 613 aa9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.39□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 POTEIP0CG38 1075 aa9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 POTEJP0CG39 1038 aa9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
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