RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE6B	P35913	854 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ERBB4	Q15303	1308 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	TTLL6	Q8N841	843 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP98	P52948	1817 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SBF1	O95248	1867 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	28.52	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	MYL6B	P14649	208 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	PDIA6	Q15084	440 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC184	Q52MB2	194 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	NGEF	Q8N5V2	710 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QTNF8	P60827	252 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ST5	P78524	1137 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	APAF1	O14727	1248 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	NPHP1	O15259	732 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SRGN	P10124	158 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT24	Q2M2I5	525 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PROSER3	Q2NL68	480 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP44	Q96MT7	982 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.15
PPP4C-205	ENST00000563200	STYK1	Q6J9G0	422 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SLX4	Q8IY92	1834 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF853	P0CG23	659 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ANXA1	P04083	346 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PRELP	P51888	382 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RASSF7	Q02833	373 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	MASTL	Q96GX5	879 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF181	Q9P0P0	153 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNA1S	Q13698	1873 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM177B	A6PVY3	158 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	NFKBIE	O00221	500 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CNKSR1	Q969H4	720 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP350	Q5VT06	3117 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXB7	P09629	217 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	NECTIN2	Q92692	538 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	MBIP	Q9NS73	344 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF3C	O14782	793 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	C21orf2	O43822	256 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	GPT	P24298	496 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NYX	Q9GZU5	481 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCC12	Q96J65	1359 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NPR1	P16066	1061 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	LMNB1	P20700	586 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	IFT57	Q9NWB7	429 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SUSD4	Q5VX71	490 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	COPS6	Q7L5N1	327 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ANP32C	O43423	234 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CRY2	Q49AN0	593 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ERFE	Q4G0M1	354 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NTSR2	O95665	410 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	GNAI1	P63096	354 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-205	ENST00000563200	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PARP10	Q53GL7	1025 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-205	ENST00000563200	MRS2	Q9HD23	443 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-205	ENST00000563200	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-205	ENST00000563200	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC27	Q2M243	656 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-205	ENST00000563200	SOGA3	Q5TF21	947 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-205	ENST00000563200	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		28.28	■■■□□ 2.12

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms