RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 NEFLP07196 543 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 ACDQ96AP0 544 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 RHOQP17081 205 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 NLRP1Q9C000 1473 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 LRP6O75581 1613 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 KRBA1A5PL33 1030 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 PDE4CQ08493 712 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 POTEAQ6S8J7 498 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 PHLPP1O60346 1717 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 TOM1O60784 492 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 ADH1AP07327 375 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 RAB15P59190 212 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 ZBTB33Q86T24 672 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 MIA2Q96PC5 1412 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 KIF3BO15066 747 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 LILRB3O75022 631 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 DBN1Q16643 649 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 NWD1Q149M9 1564 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 PTGIRP43119 386 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 CEP162Q5TB80 1403 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-209ENST00000561136 SLIT1O75093 1534 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 BARGINQ6ZT62 677 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 GMCL1Q96IK5 515 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 OIP5O43482 229 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 LILRA1O75019 489 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 MX2P20592 715 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 LTKP29376 864 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM94Q12767 1356 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 ADGRB3O60242 1522 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 COL8A1P27658 744 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 TET3O43151 1660 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 SHPRHQ149N8 1683 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 DIP2AQ14689 1571 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 H7C1W4 665 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 ZMYND10O75800 440 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 RRAGCQ9HB90 399 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-209ENST00000561136 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 ADAM32Q8TC27 787 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 PTK2Q05397 1052 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 GRIN2CQ14957 1233 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 CYLDQ9NQC7 956 aa8.01□□□□□ -1.13
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