RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 KLRG1Q96E93 195 aa21.66■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 CFAP53Q96M91 514 aa21.66■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.65■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 SRGNP10124 158 aa21.65■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 CNBD1Q8NA66 436 aa21.64■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.64■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 SETDB2Q96T68 719 aa21.64■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.64■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.63■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 STYK1Q6J9G0 422 aa21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUDCQ9Y266 331 aa21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 SCN4AP35499 1836 aa21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.61■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 SNED1Q8TER0 1413 aa21.61■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.6■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.6■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 HLFQ16534 295 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 MASTLQ96GX5 879 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-207ENST00000560622 RGL2O15211 777 aa21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 ST5P78524 1137 aa21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 ERFEQ4G0M1 354 aa21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 OLFM4Q6UX06 510 aa21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 CNKSR1Q969H4 720 aa21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 POTEIP0CG38 1075 aa21.56■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 POTEJP0CG39 1038 aa21.56■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 COL4A5P29400 1685 aa21.56■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABCC12Q96J65 1359 aa21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 LAMB2P55268 1798 aa21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 NPR1P16066 1061 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-207ENST00000560622 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC51AQ86UW1 340 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 LTBP1Q14766 1721 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM177BA6PVY3 158 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 NFE2L2Q16236 605 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 CRY2Q49AN0 593 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 SOGA3Q5TF21 947 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 NPHP1O15259 732 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCDC93Q567U6 631 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 TAF1P21675 1872 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 CHADLQ6NUI6 762 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 PASKQ96RG2 1323 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-207ENST00000560622 NGEFQ8N5V2 710 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 PDIA6Q15084 440 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 FZD9O00144 591 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 SUSD4Q5VX71 490 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 NTSR2O95665 410 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYL6BP14649 208 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 SYNE4Q8N205 404 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 CREBZFQ9NS37 354 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 GPTP24298 496 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 PROSER3Q2NL68 480 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-207ENST00000560622 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
USP3-AS1-207ENST00000560622 ALDH1B1P30837 517 aa21.39■■□□□ 1.01
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