RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 LTKP29376 864 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 KIFC2Q96AC6 838 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 LAMC1P11047 1609 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF592Q92610 1267 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 RAB15P59190 212 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 PIP4K2BP78356 416 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 ABL2P42684 1182 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 FLIIQ13045 1269 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 CBLBQ13191 982 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 Q6ZVU0 165 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 ZFP42Q96MM3 310 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 COG6Q9Y2V7 657 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 EID1Q9Y6B2 187 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 QRICH2Q9H0J4 1663 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 SCARF1Q14162 830 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 LILRA1O75019 489 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 UPP2O95045 317 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 VAC14Q08AM6 782 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 RGL3Q3MIN7 710 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 FBXO41Q8TF61 875 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 POM121Q96HA1 1249 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 PTPRUQ92729 1446 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 BMP2P12643 396 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 CYLDQ9NQC7 956 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 ITSN1Q15811 1721 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 ABCA3Q99758 1704 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 ADH1AP07327 375 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 WASHC4Q2M389 1173 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 RNF20Q5VTR2 975 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 C14orf37Q86TY3 774 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC125Q86Z20 511 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM94Q12767 1356 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 SPINT1O43278 529 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 ERVK-9P63128 1117 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 METP08581 1390 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 USP32Q8NFA0 1604 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-204ENST00000558666 SHPRHQ149N8 1683 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 SOX11P35716 441 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 MYOM2P54296 1465 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 SOBPA7XYQ1 873 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 RAD21O60216 631 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 KCNA6P17658 529 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 SCTRP47872 440 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 RELBQ01201 579 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 WWC1Q8IX03 1113 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.26□□□□□ -1.41
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