RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CACNA1SQ13698 1873 aa18.08■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SCN4AP35499 1836 aa18.08■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KCNQ3O43525 872 aa18.08■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MASTLQ96GX5 879 aa18.08■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ST5P78524 1137 aa18.07■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCDC24Q8N4L8 307 aa18.07■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CREBZFQ9NS37 354 aa18.07■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 USP16Q9Y5T5 823 aa18.07■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BTBD11A6QL63 1104 aa18.06■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRKAR2BP31323 418 aa18.06■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHADLQ6NUI6 762 aa18.06■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.05■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TNS4Q8IZW8 715 aa18.05■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SNED1Q8TER0 1413 aa18.05■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PASKQ96RG2 1323 aa18.04■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.04■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 POTEIP0CG38 1075 aa18.03■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 POTEJP0CG39 1038 aa18.03■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.02■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.02■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NBPF26B4DH59 902 aa18.02■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NPR1P16066 1061 aa18.02■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCDC93Q567U6 631 aa18.02■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NBPF15Q8N660 670 aa18.02■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.02■□□□□ 0.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CFAP53Q96M91 514 aa18.01■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CNTNAP1P78357 1384 aa18.01■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LDHDQ86WU2 507 aa18■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RIC1Q4ADV7 1423 aa17.99■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NUDCQ9Y266 331 aa17.99■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KDM3BQ7LBC6 1761 aa17.99■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NPHP1O15259 732 aa17.98■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TPTE2Q6XPS3 522 aa17.98■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CRY2Q49AN0 593 aa17.97■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MCM10Q7L590 875 aa17.97■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RTKN2Q8IZC4 609 aa17.97■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF541Q9H0D2 1346 aa17.97■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FZD9O00144 591 aa17.96■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PPP2R1AP30153 589 aa17.96■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PSMD1Q99460 953 aa17.95■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NUP98P52948 1817 aa17.94■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ALDH1B1P30837 517 aa17.94■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HLFQ16534 295 aa17.94■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HACL1Q9UJ83 578 aa17.94■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ERVV-1B6SEH8 477 aa17.93■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DCTN1Q14203 1278 aa17.93■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 OLFM4Q6UX06 510 aa17.93■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRDM10Q9NQV6 1147 aa17.93■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DLG5Q8TDM6 1919 aa17.93■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL4A5P29400 1685 aa17.93■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ABCC12Q96J65 1359 aa17.92■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMEM88BA6NKF7 163 aa17.92■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CAPN15O75808 1086 aa17.92■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IARSP41252 1262 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 THSD7BQ9C0I4 1608 aa17.91■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RASSF10A6NK89 507 aa17.91■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FOXN1O15353 648 aa17.91■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EPHX2P34913 555 aa17.91■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa17.91■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GPC2Q8N158 579 aa17.91■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LTBP1Q14766 1721 aa17.9■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SYNE4Q8N205 404 aa17.9■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NYXQ9GZU5 481 aa17.9■□□□□ 0.46
TMC3-AS1-201ENST00000558086 VEGFBP49765 207 aa17.89■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GRIPAP1Q4V328 841 aa17.89■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-201ENST00000558086 WBP1LQ9NX94 342 aa17.89■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RNF123Q5XPI4 1314 aa17.89■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa17.89■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-201ENST00000558086 UBN2Q6ZU65 1347 aa17.88■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
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