RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555676.5

RBM23-216, Transcript of RNA binding motif protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene RBM23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM23-216ENST00000555676 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RBM23-216ENST00000555676 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.08■□□□□ 0.17
RBM23-216ENST00000555676 NEFLP07196 543 aa16.08■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.08■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.07■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 PIM2Q9P1W9 311 aa16.07■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 CARMIL3Q8ND23 1372 aa16.07■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 BCORQ6W2J9 1755 aa16.07■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 SLFN5Q08AF3 891 aa16.06■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 IL16Q14005 1332 aa16.05■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 MYL6BP14649 208 aa16.05■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.05■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 SETDB2Q96T68 719 aa16.05■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 BABAM1Q9NWV8 329 aa16.05■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 CHL1O00533 1208 aa16.04■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 HLFQ16534 295 aa16.04■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 CLEC4GQ6UXB4 293 aa16.04■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa16.04■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.04■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.04■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.03■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.03■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 KRT24Q2M2I5 525 aa16.03■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.03■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 TTLL7Q6ZT98 887 aa16.03■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.03■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RBM23-216ENST00000555676 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.01■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 H0YIN7 160 aa16.01■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 PDIA6Q15084 440 aa16.01■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 NECTIN2Q92692 538 aa16.01■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.01■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.01■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 NUP98P52948 1817 aa16.01■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 DLEC1Q9Y238 1755 aa16■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 FAM177BA6PVY3 158 aa16■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 ANXA1P04083 346 aa16■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 PROSER3Q2NL68 480 aa16■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 CNBD1Q8NA66 436 aa16■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 CDCA7LQ96GN5 454 aa16■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 ATP10DQ9P241 1426 aa16■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 RGL2O15211 777 aa15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 NPHP1O15259 732 aa15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 PDE6BP35913 854 aa15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 CFAP44Q96MT7 982 aa15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 ADCY9O60503 1353 aa15.99■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 ERBB4Q15303 1308 aa15.98■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.98■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 TTLL6Q8N841 843 aa15.98■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 9.1
RBM23-216ENST00000555676 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 ZNF853P0CG23 659 aa15.97■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 ST5P78524 1137 aa15.97■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 MBIPQ9NS73 344 aa15.97■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.96■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.96■□□□□ 0.15
RBM23-216ENST00000555676 SBF1O95248 1867 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 SRGNP10124 158 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 GPTP24298 496 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 C9orf131Q5VYM1 1079 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.95■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 GNAI1P63096 354 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 COPS6Q7L5N1 327 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 IFT57Q9NWB7 429 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.94■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 CACNA1SQ13698 1873 aa15.93■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 PRELPP51888 382 aa15.93■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 RASSF7Q02833 373 aa15.93■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.93■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 SUSD4Q5VX71 490 aa15.93■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.93■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.93■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 SLX4Q8IY92 1834 aa15.93■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RBM23-216ENST00000555676 C21orf2O43822 256 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms