RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	MAP10	Q9P2G4	905 aa		7	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	SLIT2	O94813	1529 aa		7	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		7	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	MEIOB	Q8N635	442 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	DESI1	Q6ICB0	168 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	DISP2	A7MBM2	1401 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	NOS1	P29475	1434 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	PIK3R4	Q99570	1358 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	SPTLC1	O15269	473 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	ABCC5	O15440	1437 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM37	O94972	964 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	FSHR	P23945	695 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	GRM5	P41594	1212 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	DAPK1	P53355	1430 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	PTS	Q03393	145 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	VPS72	Q15906	364 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	LAMC1	P11047	1609 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		6.96	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		6.96	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
ATXN3-231	ENST00000554994	UTRN	P46939	3433 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	PLCB2	Q00722	1185 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	LYPD8	Q6UX82	237 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	WHAMM	Q8TF30	809 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	MYOM1	P52179	1685 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	CHD4	Q14839	1912 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	ADGRB2	O60241	1585 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	CDC14C	A4D256	554 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	TTLL8	A6PVC2	850 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	APBA3	O96018	575 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	NBPF14	Q5TI25	921 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	TSC1	Q92574	1164 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	KIF15	Q9NS87	1388 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	CFAP99	D6REC4	459 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	ZBTB7A	O95365	584 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	KANK1	Q14678	1352 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	USP32	Q8NFA0	1604 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	RREB1	Q92766	1687 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	PXDN	Q92626	1479 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	HSPA6	P17066	643 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	FOXO3	O43524	673 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	PRELP	P51888	382 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	TNS4	Q8IZW8	715 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	SYT17	Q9BSW7	474 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	MET	P08581	1390 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	ADGRL2	O95490	1459 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	IGHA1	P01876	353 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM83G	A6ND36	823 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	CBLB	Q13191	982 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR162	Q16538	588 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		6.9	□□□□□ -1.3

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