RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550722.5

HECTD4-211, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HECTD4, Length 15,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-211ENST00000550722 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 SRGAP3O43295 1099 aa7.14□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 BRD3Q15059 726 aa7.14□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 SCLT1Q96NL6 688 aa7.14□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.14□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.14□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC80Q76M96 950 aa7.14□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 CCDC144AA2RUR9 1427 aa7.13□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.13□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 RNF217Q8TC41 542 aa7.13□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.13□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 RAD21O60216 631 aa7.12□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.12□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 KDM4AO75164 1064 aa7.12□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.12□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.12□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 WHAMMQ8TF30 809 aa7.12□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 SMIM24O75264 130 aa7.12□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 STIM1Q13586 685 aa7.11□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 IFT74Q96LB3 600 aa7.11□□□□□ -1.27
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HECTD4-211ENST00000550722 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 STK38Q15208 465 aa7.11□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.11□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.11□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.11□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 SNCBQ16143 134 aa7.11□□□□□ -1.27
HECTD4-211ENST00000550722 MAP3K11Q16584 847 aa7.11□□□□□ -1.27
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