RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 HPS1Q92902 700 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 MYH16Q9H6N6 1097 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 TMEM51Q9NW97 253 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 QRICH2Q9H0J4 1663 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 TULP4Q9NRJ4 1543 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 NUTM2FA1L443 756 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 FCHSD2O94868 740 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 VEGFBP49765 207 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 RGL3Q3MIN7 710 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 FAM9BQ8IZU0 186 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 RDH13Q8NBN7 331 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 MRGPRX2Q96LB1 330 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 NINLQ9Y2I6 1382 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 FECHP22830 423 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 PDE3BQ13370 1112 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 MORN1Q5T089 497 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 KDM4CQ9H3R0 1056 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 PRDM9Q9NQV7 894 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 NUDCQ9Y266 331 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 MED14O60244 1454 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 PTPRMP28827 1452 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF521Q96K83 1311 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 TECPR2O15040 1411 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 A2ML1A8K2U0 1454 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 NLRP1Q9C000 1473 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 KNDC1Q76NI1 1749 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 PPFIA4O75335 1185 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 TPM2P07951 284 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ATP6V1AP38606 617 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 TRIM32Q13049 653 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 MYBPC2Q14324 1141 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 THAP11Q96EK4 314 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 NSD2O96028 1365 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 SHPRHQ149N8 1683 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ANKRD62A6NC57 917 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 RAPGEF3O95398 923 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 FUT2Q10981 343 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CFAP70Q5T0N1 1121 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 PXYLP1Q8TE99 480 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRB-207ENST00000549400 SERPINA10Q9UK55 444 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 IQSEC2Q5JU85 1478 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ADGRB2O60241 1585 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ALKQ9UM73 1620 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 TTC36A6NLP5 189 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRB-207ENST00000549400 KIF20AO95235 890 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ERCC3P19447 782 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 RINLQ6ZS11 566 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 NBPF11Q86T75 865 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 NGEFQ8N5V2 710 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 TMC1Q8TDI8 760 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 DRC1Q96MC2 740 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 MTA3Q9BTC8 594 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ABCC11Q96J66 1382 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRB-207ENST00000549400 CD163L1Q9NR16 1453 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CPS1P31327 1500 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 DDX11L8A8MPP1 907 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ALDH1A1P00352 501 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 PPP2R1AP30153 589 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 IDI1Q13907 227 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 HIC1Q14526 733 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 BRICD5Q6PL45 260 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CASC1Q6TDU7 716 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CLEC4GQ6UXB4 293 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 FAM117AQ9C073 453 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
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