RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546279.5

LMO3-233, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 4

Gene LMO3, Length 590 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-233	ENST00000546279	FSTL1	Q12841	308 aa		13.85	□□□□□ -0.19
LMO3-233	ENST00000546279	PDIA6	Q15084	440 aa		13.85	□□□□□ -0.19
LMO3-233	ENST00000546279	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
LMO3-233	ENST00000546279	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.85	□□□□□ -0.19
LMO3-233	ENST00000546279	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
LMO3-233	ENST00000546279		E9PSI1	815 aa		13.84	□□□□□ -0.19
LMO3-233	ENST00000546279	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
LMO3-233	ENST00000546279	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.84	□□□□□ -0.19
LMO3-233	ENST00000546279	NUP98	P52948	1817 aa		13.84	□□□□□ -0.19
LMO3-233	ENST00000546279	HOXB7	P09629	217 aa		13.83	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	SSFA2	P28290	1259 aa		13.83	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.83	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.83	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	A1BG	P04217	495 aa		13.82	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	TGFB2	P61812	414 aa		13.82	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.81	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	VAMP4	O75379	141 aa		13.81	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	PHF14	O94880	888 aa		13.81	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.81	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		13.81	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.81	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.81	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.8	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.8	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		13.8	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	BCS1L	Q9Y276	419 aa		13.8	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	WDR90	Q96KV7	1748 aa		13.8	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.79	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.79	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.78	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	GNPAT	O15228	680 aa		13.78	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	STARD3NL	O95772	234 aa		13.78	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	COL15A1	P39059	1388 aa		13.78	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.78	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
LMO3-233	ENST00000546279	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	ANXA1	P04083	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	MMP10	P09238	476 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	HTRA3	P83110	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279		A0A0G2JLW4	131 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	G2E3	Q7L622	706 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	GYS1	P13807	737 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	MYL6B	P14649	208 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	DPEP1	P16444	411 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	RRAGC	Q9HB90	399 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LMO3-233	ENST00000546279	RGL2	O15211	777 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LMO3-233	ENST00000546279	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LMO3-233	ENST00000546279	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LMO3-233	ENST00000546279	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LMO3-233	ENST00000546279	PIM2	Q9P1W9	311 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LMO3-233	ENST00000546279	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LMO3-233	ENST00000546279	HLF	Q16534	295 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LMO3-233	ENST00000546279	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LMO3-233	ENST00000546279	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LMO3-233	ENST00000546279	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LMO3-233	ENST00000546279	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
LMO3-233	ENST00000546279	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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