RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538176.5

CCDC78-215, Transcript of coiled-coil domain containing 78, human

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,166 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC78-215	ENST00000538176	ADCY9	O60503	1353 aa		28.06	■■■□□ 2.08
CCDC78-215	ENST00000538176	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		28.06	■■■□□ 2.08
CCDC78-215	ENST00000538176	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.04	■■■□□ 2.08
CCDC78-215	ENST00000538176	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		28.04	■■■□□ 2.08
CCDC78-215	ENST00000538176	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
CCDC78-215	ENST00000538176	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
CCDC78-215	ENST00000538176	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
CCDC78-215	ENST00000538176	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	28.03	■■■□□ 2.08
CCDC78-215	ENST00000538176	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	ANP32C	O43423	234 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	CFAP44	Q96MT7	982 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	MYL6B	P14649	208 aa		28	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	NGEF	Q8N5V2	710 aa		28	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	CNKSR1	Q969H4	720 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	APAF1	O14727	1248 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	HOXB7	P09629	217 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	HLF	Q16534	295 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	27.98	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	NYX	Q9GZU5	481 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	C1QTNF8	P60827	252 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	STYK1	Q6J9G0	422 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	MASTL	Q96GX5	879 aa		27.96	■■■□□ 2.07
CCDC78-215	ENST00000538176	SRGN	P10124	158 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	PDIA6	Q15084	440 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	GNAI1	P63096	354 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	SOGA3	Q5TF21	947 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	27.92	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	IFT57	Q9NWB7	429 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	NPR1	P16066	1061 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	ZNF853	P0CG23	659 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	LMNB1	P20700	586 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	PARP10	Q53GL7	1025 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	RNF181	Q9P0P0	153 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	NUP98	P52948	1817 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CCDC78-215	ENST00000538176	ALDH1B1	P30837	517 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	MRS2	Q9HD23	443 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	MBIP	Q9NS73	344 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	FAM177B	A6PVY3	158 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	CCDC27	Q2M243	656 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	COPS6	Q7L5N1	327 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	C21orf2	O43822	256 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	CCDC184	Q52MB2	194 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	SBF1	O95248	1867 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	PROSER3	Q2NL68	480 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	NECTIN2	Q92692	538 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	HYPK	Q9NX55	129 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	GPT	P24298	496 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	KRT24	Q2M2I5	525 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	SUSD4	Q5VX71	490 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CCDC78-215	ENST00000538176	ANXA1	P04083	346 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	NFKBIE	O00221	500 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	RASSF7	Q02833	373 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	CRY2	Q49AN0	593 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	KIF3C	O14782	793 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	TCIRG1	Q13488	830 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	ERFE	Q4G0M1	354 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	NTSR2	O95665	410 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	CCDC93	Q567U6	631 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	NLRP3	Q96P20	1036 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CCDC78-215	ENST00000538176	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.5 ms