RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 GLMNQ92990 594 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 AIDAQ96BJ3 306 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.253e-7■■■■■ 30.5
HDAC2-216ENST00000523628 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 EPXP11678 715 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 SOX11P35716 441 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 BTBD6Q96KE9 485 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 UCN2Q96RP3 112 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 PIK3R2O00459 728 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 CDK2AP1O14519 115 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 MTFR1Q15390 333 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PNR3 127 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 A6NJY4 79 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 BAG6P46379 1132 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 GRIN2CQ14957 1233 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 FAM182BQ5T319 152 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTS12P58397 1594 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 GNB5O14775 395 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 TNP2Q05952 138 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 HCN2Q9UL51 889 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 GRIN2AQ12879 1464 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 CUL7Q14999 1698 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 DGKGP49619 791 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 ARXQ96QS3 562 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 ZIC5Q96T25 663 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 CABP1Q9NZU7 370 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 USP3Q9Y6I4 520 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 PIK3CDO00329 1044 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 CD33P20138 364 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 ADH6P28332 368 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 EML3Q32P44 896 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 CHSY3Q70JA7 882 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 KLF15Q9UIH9 416 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 BACH1O14867 736 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 FAM157BP0CG42 384 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC2-216ENST00000523628 NUP160Q12769 1436 aa7.15□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 ARAP1Q96P48 1450 aa7.15□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 SKIP12755 728 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 SHROOM2Q13796 1616 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 NOD1Q9Y239 953 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 KIF27Q86VH2 1401 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 FURINP09958 794 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 MARK1Q9P0L2 795 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 TXLNAP40222 546 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 GTF2IP78347 998 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 LAMC2Q13753 1193 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 XP32Q5T750 250 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 CD163Q86VB7 1156 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 EFSO43281 561 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 WWC1Q8IX03 1113 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 STRN4Q9NRL3 753 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF358Q9NW07 568 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 CHRNA4P43681 627 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 PSME1Q06323 249 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 NCOA4Q13772 614 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 TEAD4Q15561 434 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC2-216ENST00000523628 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.1□□□□□ -1.27
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