RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
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RNU6-548P-201ENST00000517083 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM117BQ6P1L5 589 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAMSTRQ6ZN01 415 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa3.14□□□□□ -1.91
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RNU6-548P-201ENST00000517083 NLGN1Q8N2Q7 840 aa3.14□□□□□ -1.91
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RNU6-548P-201ENST00000517083 COL18A1P39060 1754 aa3.14□□□□□ -1.91
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RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF1AQ12756 1690 aa3.14□□□□□ -1.91
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TTLL6Q8N841 843 aa3.13□□□□□ -1.91
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RNU6-548P-201ENST00000517083 CARD10Q9BWT7 1032 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
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RNU6-548P-201ENST00000517083 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.1□□□□□ -1.91
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RNU6-548P-201ENST00000517083 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
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RNU6-548P-201ENST00000517083 RMDN1Q96DB5 314 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERO1AQ96HE7 468 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 GYS1P13807 737 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 GJA8P48165 433 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 TFF2Q03403 129 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRIN2CQ14957 1233 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC37L1Q7L3B6 337 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 ASCL5Q7RTU5 278 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD99L2Q8TCZ2 262 aa3.09□□□□□ -1.91
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