RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 ANXA1P04083 346 aa20.53■□□□□ 0.88
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SERF1B-208ENST00000515588 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.53■□□□□ 0.88
SERF1B-208ENST00000515588 BCS1LQ9Y276 419 aa20.52■□□□□ 0.88
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.52■□□□□ 0.88
SERF1B-208ENST00000515588 CHD4Q14839 1912 aa20.52■□□□□ 0.88
SERF1B-208ENST00000515588 GNAI1P63096 354 aa20.51■□□□□ 0.87
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SERF1B-208ENST00000515588 WWC1Q8IX03 1113 aa20.5■□□□□ 0.87
SERF1B-208ENST00000515588 PIM2Q9P1W9 311 aa20.5■□□□□ 0.87
SERF1B-208ENST00000515588 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
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SERF1B-208ENST00000515588 CNBD1Q8NA66 436 aa20.49■□□□□ 0.87
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SERF1B-208ENST00000515588 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SERF1B-208ENST00000515588 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.47■□□□□ 0.87
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SERF1B-208ENST00000515588 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.47■□□□□ 0.87
SERF1B-208ENST00000515588 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
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SERF1B-208ENST00000515588 FAM177BA6PVY3 158 aa20.45■□□□□ 0.86
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SERF1B-208ENST00000515588 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SERF1B-208ENST00000515588 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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SERF1B-208ENST00000515588 ST5P78524 1137 aa20.44■□□□□ 0.86
SERF1B-208ENST00000515588 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SERF1B-208ENST00000515588 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.44■□□□□ 0.86
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SERF1B-208ENST00000515588 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.43■□□□□ 0.86
SERF1B-208ENST00000515588 TSPYL6Q8N831 410 aa20.43■□□□□ 0.86
SERF1B-208ENST00000515588 TTLL6Q8N841 843 aa20.42■□□□□ 0.86
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SERF1B-208ENST00000515588 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.41■□□□□ 0.86
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SERF1B-208ENST00000515588 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.41■□□□□ 0.86
SERF1B-208ENST00000515588 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SERF1B-208ENST00000515588 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SERF1B-208ENST00000515588 SRGNP10124 158 aa20.4■□□□□ 0.86
SERF1B-208ENST00000515588 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.4■□□□□ 0.86
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
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SERF1B-208ENST00000515588 ADCY9O60503 1353 aa20.38■□□□□ 0.85
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SERF1B-208ENST00000515588 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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SERF1B-208ENST00000515588 STYK1Q6J9G0 422 aa20.37■□□□□ 0.85
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SERF1B-208ENST00000515588 NYXQ9GZU5 481 aa20.37■□□□□ 0.85
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SERF1B-208ENST00000515588 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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SERF1B-208ENST00000515588 PARP10Q53GL7 1025 aa20.35■□□□□ 0.85
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SERF1B-208ENST00000515588 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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SERF1B-208ENST00000515588 C21orf2O43822 256 aa20.33■□□□□ 0.85
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SERF1B-208ENST00000515588 RASSF7Q02833 373 aa20.33■□□□□ 0.85
SERF1B-208ENST00000515588 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SERF1B-208ENST00000515588 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SERF1B-208ENST00000515588 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.33■□□□□ 0.85
SERF1B-208ENST00000515588 CNKSR1Q969H4 720 aa20.33■□□□□ 0.85
SERF1B-208ENST00000515588 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SERF1B-208ENST00000515588 SLX4Q8IY92 1834 aa20.32■□□□□ 0.84
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SERF1B-208ENST00000515588 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SERF1B-208ENST00000515588 PRELPP51888 382 aa20.32■□□□□ 0.84
SERF1B-208ENST00000515588 CRY2Q49AN0 593 aa20.32■□□□□ 0.84
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