RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514834.1

ITGA3-214, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-214ENST00000514834 PROSER3Q2NL68 480 aa18.19■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.19■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 NECTIN2Q92692 538 aa18.19■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.19■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 ADCY9O60503 1353 aa18.18■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 ATP10DQ9P241 1426 aa18.18■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.18■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.18■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 BABAM1Q9NWV8 329 aa18.18■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 NUP98P52948 1817 aa18.17■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 FAM177BA6PVY3 158 aa18.17■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 CNBD1Q8NA66 436 aa18.16■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.16■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 H0YIN7 160 aa18.15■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.15■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.15■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.15■□□□□ 0.5
ITGA3-214ENST00000514834 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF853P0CG23 659 aa18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 TTLL6Q8N841 843 aa18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 CFAP44Q96MT7 982 aa18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 MRS2Q9HD23 443 aa18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 MBIPQ9NS73 344 aa18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 SBF1O95248 1867 aa18.12■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 NPHP1O15259 732 aa18.12■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 GPTP24298 496 aa18.12■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 PDE6BP35913 854 aa18.12■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 PRELPP51888 382 aa18.12■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 ERBB4Q15303 1308 aa18.12■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 RGL2O15211 777 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 ST5P78524 1137 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 RASSF7Q02833 373 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 IFFO2Q5TF58 517 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 SLX4Q8IY92 1834 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 CACNA1SQ13698 1873 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 SRGNP10124 158 aa18.1■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.1■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 SUSD4Q5VX71 490 aa18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 COPS6Q7L5N1 327 aa18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 ABCC12Q96J65 1359 aa18.08■□□□□ 0.49
ITGA3-214ENST00000514834 C21orf2O43822 256 aa18.08■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 IFT57Q9NWB7 429 aa18.08■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 NFKBIEO00221 500 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 ERFEQ4G0M1 354 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 STYK1Q6J9G0 422 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 RNF181Q9P0P0 153 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 C1QTNF8P60827 252 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF428Q96B54 188 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 GNAI1P63096 354 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 MASTLQ96GX5 879 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 NTSR2O95665 410 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 HOXB7P09629 217 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 OLFM4Q6UX06 510 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 WWC1Q8IX03 1113 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 NPR1P16066 1061 aa18.03■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 SLC51AQ86UW1 340 aa18.03■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 SYNE4Q8N205 404 aa18.03■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 TSPYL6Q8N831 410 aa18.03■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 CNKSR1Q969H4 720 aa18.03■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.02■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 KIF3CO14782 793 aa18.02■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 CCDC27Q2M243 656 aa18.02■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 NYXQ9GZU5 481 aa18.02■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.02■□□□□ 0.48
ITGA3-214ENST00000514834 LMNB1P20700 586 aa18.01■□□□□ 0.47
ITGA3-214ENST00000514834 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms