RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514146.1

TRIM52-AS1-204, Transcript of TRIM52 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene TRIM52-AS1, Length 807 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 NPHP1O15259 732 aa35.44■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 C21orf2O43822 256 aa35.44■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ZNF652Q9Y2D9 606 aa35.44■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 SLX4Q8IY92 1834 aa35.43■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa35.42■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 RGL2O15211 777 aa35.42■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 SRGNP10124 158 aa35.42■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 APLP1P51693 650 aa35.41■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 STYK1Q6J9G0 422 aa35.41■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 LAMB4A4D0S4 1761 aa35.41■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 RALBP1Q15311 655 aa35.4■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 HLFQ16534 295 aa35.4■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 CNKSR1Q969H4 720 aa35.4■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP35.4■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 GLTPD2A6NH11 291 aa35.39■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 MASTLQ96GX5 879 aa35.39■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 CACNA1SQ13698 1873 aa35.39■■■■□ 3.26
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa35.38■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 TPTE2Q6XPS3 522 aa35.36■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 TIAM2Q8IVF5 1701 aa35.35■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa35.34■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 FSTL1Q12841 308 aa35.34■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 NGEFQ8N5V2 710 aa35.34■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa35.33■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 FAM177BA6PVY3 158 aa35.32■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 NUP98P52948 1817 aa35.32■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 LTBP3Q9NS15 1303 aa35.32■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 C7orf43Q8WVR3 580 aa35.31■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ERVV-1B6SEH8 477 aa35.3■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 RIPK4P57078 832 aa35.3■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 TTLL7Q6ZT98 887 aa35.3■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 NPR1P16066 1061 aa35.29■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ERFEQ4G0M1 354 aa35.29■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 TAOK3Q9H2K8 898 aa35.29■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa35.28■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 POTECB2RU33 542 aa35.27■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 MYL6BP14649 208 aa35.27■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 SOGA3Q5TF21 947 aa35.27■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 TMPOP42166 694 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 TSPYL4Q9UJ04 414 aa35.26■■■■□ 3.24
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 DPY19L2Q6NUT2 758 aa35.25■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 SMC1BQ8NDV3 1235 aa35.25■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 WDR90Q96KV7 1748 aa35.25■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 HTRA3P83110 453 aa35.23■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 KIF6Q6ZMV9 814 aa35.22■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ZBTB3Q9H5J0 574 aa35.21■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 BABAM1Q9NWV8 329 aa35.21■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ERBB4Q15303 1308 aa35.21■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 CCDC93Q567U6 631 aa35.2■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 NUTM1Q86Y26 1132 aa35.2■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 NYXQ9GZU5 481 aa35.2■■■■□ 3.23
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 PDIA6Q15084 440 aa35.19■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 OLFM4Q6UX06 510 aa35.19■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 LRP10Q7Z4F1 713 aa35.19■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ABCC12Q96J65 1359 aa35.18■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 UBN2Q6ZU65 1347 aa35.18■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 GPTP24298 496 aa35.18■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 CCDC146Q8IYE0 955 aa35.18■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.17■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ZNF34Q8IZ26 560 aa35.17■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ALDH1B1P30837 517 aa35.16■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 CRY2Q49AN0 593 aa35.16■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 SUSD4Q5VX71 490 aa35.16■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 DDNO94850 711 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 NEUROD2Q15784 382 aa35.14■■■■□ 3.22
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 PROSER3Q2NL68 480 aa35.13■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ANXA1P04083 346 aa35.12■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 RTKN2Q8IZC4 609 aa35.12■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 KLRG1Q96E93 195 aa35.12■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 RUNDC1Q96C34 613 aa35.11■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 TRIM35Q9UPQ4 493 aa35.11■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 CHL1O00533 1208 aa35.09■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 NTSR2O95665 410 aa35.09■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 ADAMTS8Q9UP79 889 aa35.09■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 RIC1Q4ADV7 1423 aa35.08■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.07■■■■□ 3.2
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 SYNE4Q8N205 404 aa35.07■■■■□ 3.2
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 SNED1Q8TER0 1413 aa35.06■■■■□ 3.2
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 KRT24Q2M2I5 525 aa35.06■■■■□ 3.2
TRIM52-AS1-204ENST00000514146 NECTIN2Q92692 538 aa35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms