RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504927.5

DDR1-255, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene DDR1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-255ENST00000504927 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.73■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.73■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.73■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 SCN7AQ01118 1682 aa26.73■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.72■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 GOLGA2Q08379 1002 aa26.71■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 PROSER3Q2NL68 480 aa26.71■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.71■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 HYPKQ9NX55 129 aa26.71■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.71■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.71■■□□□ 1.87
DDR1-255ENST00000504927 HLFQ16534 295 aa26.7■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 ANXA1P04083 346 aa26.69■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 GPR162Q16538 588 aa26.69■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.69■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 COPS6Q7L5N1 327 aa26.69■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 ZNF521Q96K83 1311 aa26.68■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.68■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.67■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 TSPYL6Q8N831 410 aa26.67■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.67■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.67■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.67■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 BCORQ6W2J9 1755 aa26.66■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.66■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 A0A0G2JLW4 131 aa26.65■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 NPHP1O15259 732 aa26.65■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 CNBD1Q8NA66 436 aa26.64■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.64■■□□□ 1.86
DDR1-255ENST00000504927 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.64■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 GRIN3BO60391 1043 aa26.63■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 DPEP1P16444 411 aa26.63■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.63■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.63■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.63■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.63■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 ST5P78524 1137 aa26.62■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.62■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 STK31Q9BXU1 1019 aa26.62■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 NYXQ9GZU5 481 aa26.62■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 PDE6BP35913 854 aa26.61■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.61■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 ATP10DQ9P241 1426 aa26.61■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 E9PSI1 815 aa26.6■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 PIM2Q9P1W9 311 aa26.6■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 VAMP4O75379 141 aa26.59■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 KCNA3P22001 575 aa26.59■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 YY1P25490 414 aa26.59■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 PARP10Q53GL7 1025 aa26.59■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 CHD4Q14839 1912 aa26.59■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 H0YIN7 160 aa26.58■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 TCIRG1Q13488 830 aa26.58■■□□□ 1.85
DDR1-255ENST00000504927 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.57■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 GPTP24298 496 aa26.56■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 FAM177BA6PVY3 158 aa26.55■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 SLC4A2P04920 1241 aa26.55■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 CHRNA5P30532 468 aa26.55■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 SLFN5Q08AF3 891 aa26.55■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.55■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 SUSD4Q5VX71 490 aa26.54■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.54■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.54■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.54■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 NUP98P52948 1817 aa26.53■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 BCS1LQ9Y276 419 aa26.53■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.52■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
DDR1-255ENST00000504927 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.5■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 NLRP10Q86W26 655 aa26.5■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 TTLL6Q8N841 843 aa26.5■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 NTSR2O95665 410 aa26.49■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.49■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 SRGNP10124 158 aa26.48■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 ERFEQ4G0M1 354 aa26.48■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 STYK1Q6J9G0 422 aa26.48■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 KSR2Q6VAB6 950 aa26.48■■□□□ 1.83
DDR1-255ENST00000504927 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.48■■□□□ 1.83
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