RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496553.5

NDUFS2-215, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S2, human

TSL 2

Gene NDUFS2, Length 888 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFS2-215	ENST00000496553	NBPF15	Q8N660	670 aa		27.78	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	CNKSR1	Q969H4	720 aa		27.78	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	27.77	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	STYK1	Q6J9G0	422 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		27.75	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	C21orf2	O43822	256 aa		27.74	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	SOGA3	Q5TF21	947 aa		27.74	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	MASTL	Q96GX5	879 aa		27.74	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	RIPK4	P57078	832 aa		27.73	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		27.73	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	SRGN	P10124	158 aa		27.72	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	RRAGC	Q9HB90	399 aa		27.72	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		27.72	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	NFKBIE	O00221	500 aa		27.71	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	APLP1	P51693	650 aa		27.71	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		27.71	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	NGEF	Q8N5V2	710 aa		27.71	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		27.69	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	27.69	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		27.69	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	ERBB4	Q15303	1308 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	CACNA1S	Q13698	1873 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	GLTPD2	A6NH11	291 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	FAM177B	A6PVY3	158 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	MYL6B	P14649	208 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	NPR1	P16066	1061 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	NYX	Q9GZU5	481 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	FSTL1	Q12841	308 aa		27.67	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	HLF	Q16534	295 aa		27.67	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		27.67	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		27.67	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		27.66	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	PRELP	P51888	382 aa		27.65	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	ERFE	Q4G0M1	354 aa		27.65	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	SLX4	Q8IY92	1834 aa		27.64	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	ALDH1B1	P30837	517 aa		27.62	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	CCDC93	Q567U6	631 aa		27.62	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		27.62	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	NUP98	P52948	1817 aa		27.62	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	NEUROD2	Q15784	382 aa		27.61	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		27.61	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		27.61	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	RUNDC1	Q96C34	613 aa		27.61	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		27.61	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	CEP350	Q5VT06	3117 aa		27.6	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	GPT	P24298	496 aa		27.57	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	WDR90	Q96KV7	1748 aa		27.56	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		27.56	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		27.56	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		27.55	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		27.55	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	27.54	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		27.54	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	PARP10	Q53GL7	1025 aa		27.54	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	ABCC12	Q96J65	1359 aa		27.53	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		27.53	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		27.52	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	CRY2	Q49AN0	593 aa		27.52	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		27.52	■■■□□ 2
NDUFS2-215	ENST00000496553	SUSD4	Q5VX71	490 aa		27.51	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	CHL1	O00533	1208 aa		27.5	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	PDIA6	Q15084	440 aa		27.5	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		27.5	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		27.5	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	NECTIN2	Q92692	538 aa		27.49	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		27.49	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	NTSR2	O95665	410 aa		27.48	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.47	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	ANXA1	P04083	346 aa		27.47	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	PROSER3	Q2NL68	480 aa		27.47	■■□□□ 1.99

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