RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495640.1

COPS3-211, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 333 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-211ENST00000495640 PDGFAP04085 211 aa5.12□□□□□ -1.59
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COPS3-211ENST00000495640 ALDH1A1P00352 501 aa5.07□□□□□ -1.6
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COPS3-211ENST00000495640 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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COPS3-211ENST00000495640 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.07□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.07□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.07□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 MRS2Q9HD23 443 aa5.07□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.07□□□□□ -1.6
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COPS3-211ENST00000495640 MEN1O00255 615 aa5.06□□□□□ -1.6
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COPS3-211ENST00000495640 SMPD1P17405 629 aa5.06□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 GPR152Q8TDT2 470 aa5.06□□□□□ -1.6
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COPS3-211ENST00000495640 CRELD1Q96HD1 420 aa5.06□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 DNAJC25Q9H1X3 360 aa5.06□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 AK5Q9Y6K8 562 aa5.06□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 OPLAHO14841 1288 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 GPC1P35052 558 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 ZNF76P36508 570 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 ITGAEP38570 1179 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 C4orf17Q53FE4 359 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-211ENST00000495640 CYP4X1Q8N118 509 aa5.05□□□□□ -1.6
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