RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 CNBD1Q8NA66 436 aa36.71■■■■□ 3.47
HOXB3-211ENST00000490677 PDE6BP35913 854 aa36.7■■■■□ 3.47
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HOXB3-211ENST00000490677 RASSF7Q02833 373 aa36.7■■■■□ 3.47
HOXB3-211ENST00000490677 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa36.7■■■■□ 3.47
HOXB3-211ENST00000490677 HLFQ16534 295 aa36.68■■■■□ 3.46
HOXB3-211ENST00000490677 RNF181Q9P0P0 153 aa36.68■■■■□ 3.46
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HOXB3-211ENST00000490677 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
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HOXB3-211ENST00000490677 ADAMTS8Q9UP79 889 aa36.59■■■■□ 3.45
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HOXB3-211ENST00000490677 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
HOXB3-211ENST00000490677 C7orf43Q8WVR3 580 aa36.52■■■■□ 3.44
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HOXB3-211ENST00000490677 FAM177BA6PVY3 158 aa36.5■■■■□ 3.43
HOXB3-211ENST00000490677 PROSER3Q2NL68 480 aa36.5■■■■□ 3.43
HOXB3-211ENST00000490677 LTBP3Q9NS15 1303 aa36.5■■■■□ 3.43
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB3Q9H5J0 574 aa36.49■■■■□ 3.43
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HOXB3-211ENST00000490677 NUTM1Q86Y26 1132 aa36.44■■■■□ 3.42
HOXB3-211ENST00000490677 LAMB2P55268 1798 aa36.44■■■■□ 3.42
HOXB3-211ENST00000490677 GPTP24298 496 aa36.43■■■■□ 3.42
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HOXB3-211ENST00000490677 NYXQ9GZU5 481 aa36.42■■■■□ 3.42
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HOXB3-211ENST00000490677 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP36.35■■■■□ 3.41
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HOXB3-211ENST00000490677 CCDC184Q52MB2 194 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXB3-211ENST00000490677 COPS6Q7L5N1 327 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXB3-211ENST00000490677 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
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HOXB3-211ENST00000490677 XAGE3Q8WTP9 111 aa36.33■■■■□ 3.41
HOXB3-211ENST00000490677 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 HOXB7P09629 217 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
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