RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KRT24Q2M2I5 525 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BCORQ6W2J9 1755 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF853P0CG23 659 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CHRNA5P30532 468 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC27Q2M243 656 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 H0YIN7 160 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PDE6BP35913 854 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HLFQ16534 295 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WWC1Q8IX03 1113 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KCNA3P22001 575 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANXA1P04083 346 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PDIA6Q15084 440 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CHD4Q14839 1912 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM177BA6PVY3 158 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PROSER3Q2NL68 480 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NYXQ9GZU5 481 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COPS6Q7L5N1 327 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IL16Q14005 1332 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATP10DQ9P241 1426 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GPTP24298 496 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TTLL6Q8N841 843 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HYPKQ9NX55 129 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WDR63Q8IWG1 891 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PARP10Q53GL7 1025 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CNKSR1Q969H4 720 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MASTLQ96GX5 879 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NUP98P52948 1817 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 STYK1Q6J9G0 422 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCER2I3L3R5 266 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SRGNP10124 158 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SUSD4Q5VX71 490 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GOLGA2Q08379 1002 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 STK31Q9BXU1 1019 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NPR1P16066 1061 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TCIRG1Q13488 830 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ERFEQ4G0M1 354 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TSPYL6Q8N831 410 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NTSR2O95665 410 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ABCC12Q96J65 1359 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C21orf2O43822 256 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SOGA3Q5TF21 947 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NLRP10Q86W26 655 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms