RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 ALBP02768 609 aa7.32□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 SKIP12755 728 aa7.32□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 GTF2IP78347 998 aa7.32□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.32□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 EML3Q32P44 896 aa7.32□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.32□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 DYRK3O43781 588 aa7.31□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 LAMC2Q13753 1193 aa7.31□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.31□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.31□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 ZNF358Q9NW07 568 aa7.31□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 NOS2P35228 1153 aa7.3□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 ADH7P40394 386 aa7.3□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 WASHC4Q2M389 1173 aa7.3□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.3□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 TNS4Q8IZW8 715 aa7.3□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.3□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.3□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 NOD1Q9Y239 953 aa7.3□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.3□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.29□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 SIN3BO75182 1162 aa7.29□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 SPEM2Q0P670 501 aa7.29□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.29□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.29□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 IGFLR1Q9H665 355 aa7.29□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 NCOA4Q13772 614 aa7.28□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.28□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.28□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 CEP63Q96MT8 703 aa7.28□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 SERTM1A2A2V5 107 aa7.27□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.27□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 NEUROD1Q13562 356 aa7.27□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 TEAD4Q15561 434 aa7.27□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 NBPF11Q86T75 865 aa7.27□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 NACC1Q96RE7 527 aa7.27□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 MDFIQ99750 246 aa7.27□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.27□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.27□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 SFI1A8K8P3 1242 aa7.26□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 EML1O00423 815 aa7.26□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 BHMTQ93088 406 aa7.26□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 BRD7Q9NPI1 651 aa7.26□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 NID1P14543 1247 aa7.25□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 SOX11P35716 441 aa7.25□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 ARTNQ5T4W7 220 aa7.25□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 TNFRSF25Q93038 417 aa7.25□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.24□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 NUDT8Q8WV74 236 aa7.24□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 USP17L5A8MUK1 530 aa7.23□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 LILRB5O75023 590 aa7.23□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 EPHA4P54764 986 aa7.23□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.23□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.23□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.22□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.22□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.22□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.22□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.22□□□□□ -1.25
SENP6-210ENST00000487548 A0A0A0MRY4 1105 aa7.21□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 SELPP16109 830 aa7.21□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 MCM6Q14566 821 aa7.21□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 MBTPS1Q14703 1052 aa7.21□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 TP53INP1Q96A56 240 aa7.21□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 USP21Q9UK80 565 aa7.21□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.21□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 C9orf172C9J069 976 aa7.2□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 RAC1P63000 192 aa7.2□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 TYRO3Q06418 890 aa7.2□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.2□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 ELNP15502 786 aa7.19□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 CCDC102BQ68D86 513 aa7.19□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.19□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.19□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 NGLY1Q96IV0 654 aa7.19□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 SUSD3Q96L08 255 aa7.19□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 ALG2Q9H553 416 aa7.19□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.19□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.19□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 COG6Q9Y2V7 657 aa7.19□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 ADGRE1Q14246 886 aa7.18□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 TRIM50Q86XT4 487 aa7.18□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 CLDN10P78369 228 aa7.17□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.17□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.17□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SENP6-210ENST00000487548 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.2 ms