RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-208ENST00000484908 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 NBPF15Q8N660 670 aa23.74■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 NFKBIEO00221 500 aa23.73■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.73■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 APLP1P51693 650 aa23.72■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 PRELPP51888 382 aa23.72■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.72■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.72■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 CACNA1SQ13698 1873 aa23.72■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.71■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 RALBP1Q15311 655 aa23.71■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 STYK1Q6J9G0 422 aa23.71■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 CNKSR1Q969H4 720 aa23.71■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 RRAGCQ9HB90 399 aa23.71■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
ATP6AP1-208ENST00000484908 C21orf2O43822 256 aa23.7■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLX4Q8IY92 1834 aa23.7■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 SRGNP10124 158 aa23.69■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 MASTLQ96GX5 879 aa23.69■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 GLTPD2A6NH11 291 aa23.68■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 FSTL1Q12841 308 aa23.67■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.67■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 NUP98P52948 1817 aa23.66■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.65■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 HLFQ16534 295 aa23.65■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 SOGA3Q5TF21 947 aa23.65■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
ATP6AP1-208ENST00000484908 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.64■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 WDR90Q96KV7 1748 aa23.64■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.63■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 NPR1P16066 1061 aa23.63■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.62■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 NGEFQ8N5V2 710 aa23.62■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.61■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 FAM177BA6PVY3 158 aa23.61■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 RIPK4P57078 832 aa23.61■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 ERFEQ4G0M1 354 aa23.61■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.61■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 ERBB4Q15303 1308 aa23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.6■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 MYL6BP14649 208 aa23.59■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.59■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.59■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.59■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 NYXQ9GZU5 481 aa23.59■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.59■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 CCDC93Q567U6 631 aa23.58■■□□□ 1.37
ATP6AP1-208ENST00000484908 ALDH1B1P30837 517 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 POTECB2RU33 542 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 ABCC12Q96J65 1359 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 CRY2Q49AN0 593 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 GPTP24298 496 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-208ENST00000484908 HTRA3P83110 453 aa23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 PDIA6Q15084 440 aa23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 SUSD4Q5VX71 490 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 RUNDC1Q96C34 613 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 KLRG1Q96E93 195 aa23.5■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 NEUROD2Q15784 382 aa23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 PARP10Q53GL7 1025 aa23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 OLFM4Q6UX06 510 aa23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 SCN4AP35499 1836 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 NTSR2O95665 410 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 CHL1O00533 1208 aa23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 PROSER3Q2NL68 480 aa23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP1-208ENST00000484908 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.45■■□□□ 1.34
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