RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 CACNA1SQ13698 1873 aa26.58■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.58■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.57■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 RRAGCQ9HB90 399 aa26.57■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 NBPF26B4DH59 902 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 RGL2O15211 777 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 C21orf2O43822 256 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 APLP1P51693 650 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 STYK1Q6J9G0 422 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 NBPF15Q8N660 670 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 MASTLQ96GX5 879 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 NGEFQ8N5V2 710 aa26.55■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.54■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 SRGNP10124 158 aa26.53■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 SOGA3Q5TF21 947 aa26.53■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 FAM177BA6PVY3 158 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 NFKBIEO00221 500 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ACTB-212ENST00000484841 GLTPD2A6NH11 291 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 RIPK4P57078 832 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 FSTL1Q12841 308 aa26.5■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.5■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 SLX4Q8IY92 1834 aa26.49■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 MYL6BP14649 208 aa26.49■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 NPR1P16066 1061 aa26.49■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 ERFEQ4G0M1 354 aa26.49■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 HLFQ16534 295 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 NYXQ9GZU5 481 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 NUP98P52948 1817 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 PRELPP51888 382 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.46■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.46■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.45■■□□□ 1.83
ACTB-212ENST00000484841 ERBB4Q15303 1308 aa26.44■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 CCDC93Q567U6 631 aa26.44■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 ALDH1B1P30837 517 aa26.43■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.43■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 WDR90Q96KV7 1748 aa26.42■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 NEUROD2Q15784 382 aa26.42■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.42■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.41■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.41■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 GPTP24298 496 aa26.39■■□□□ 1.82
ACTB-212ENST00000484841 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTB-212ENST00000484841 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTB-212ENST00000484841 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
ACTB-212ENST00000484841 RUNDC1Q96C34 613 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTB-212ENST00000484841 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.36■■□□□ 1.81
ACTB-212ENST00000484841 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.812e-6■■□□□ 13.5
ACTB-212ENST00000484841 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
ACTB-212ENST00000484841 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.35■■□□□ 1.81
ACTB-212ENST00000484841 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
ACTB-212ENST00000484841 PARP10Q53GL7 1025 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTB-212ENST00000484841 SUSD4Q5VX71 490 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTB-212ENST00000484841 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 NECTIN2Q92692 538 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 ABCC12Q96J65 1359 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.31■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.31■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 HTRA3P83110 453 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 CRY2Q49AN0 593 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 CEP350Q5VT06 3117 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 POTECB2RU33 542 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 ANXA1P04083 346 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 NLRP3Q96P20 1036 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.29■■□□□ 1.8
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