RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 HLFQ16534 295 aa24.5■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 FAM177BA6PVY3 158 aa24.49■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 NFKBIEO00221 500 aa24.49■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 C21orf2O43822 256 aa24.49■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 RIPK4P57078 832 aa24.49■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.49■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.48■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.48■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 LMNB1P20700 586 aa24.47■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.47■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 TOMM70O94826 608 aa24.46■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 SRGNP10124 158 aa24.46■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 RRAGCQ9HB90 399 aa24.46■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 CACNA1SQ13698 1873 aa24.45■■□□□ 1.51
CLK1-211ENST00000481641 SLX4Q8IY92 1834 aa24.45■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 MYL6BP14649 208 aa24.45■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.45■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.44■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.44■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 NEUROD2Q15784 382 aa24.43■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 STYK1Q6J9G0 422 aa24.43■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 CNKSR1Q969H4 720 aa24.43■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 MASTLQ96GX5 879 aa24.43■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.42■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.41■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.4■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 RGL2O15211 777 aa24.4■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.4■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.4■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 NUP98P52948 1817 aa24.4■■□□□ 1.5
CLK1-211ENST00000481641 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.39■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 GLTPD2A6NH11 291 aa24.38■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.38■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 GPTP24298 496 aa24.38■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.38■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 NPR1P16066 1061 aa24.37■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.37■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.37■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.37■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 ANXA1P04083 346 aa24.36■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 PDIA6Q15084 440 aa24.36■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 OLFM4Q6UX06 510 aa24.36■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 NECTIN2Q92692 538 aa24.36■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 RUNDC1Q96C34 613 aa24.36■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.36■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 ABCC12Q96J65 1359 aa24.35■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 PROSER3Q2NL68 480 aa24.35■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 ERFEQ4G0M1 354 aa24.35■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.35■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.35■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 KRT24Q2M2I5 525 aa24.34■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.34■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.34■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 ERBB4Q15303 1308 aa24.34■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.34■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 APLP1P51693 650 aa24.33■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 SUSD4Q5VX71 490 aa24.33■■□□□ 1.49
CLK1-211ENST00000481641 NYXQ9GZU5 481 aa24.32■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 SOGA3Q5TF21 947 aa24.31■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.31■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 POTECB2RU33 542 aa24.3■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 CHL1O00533 1208 aa24.3■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 HTRA3P83110 453 aa24.3■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 FSTL1Q12841 308 aa24.3■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 CCDC93Q567U6 631 aa24.3■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.29■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 NTSR2O95665 410 aa24.27■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 ALDH1B1P30837 517 aa24.27■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 CRY2Q49AN0 593 aa24.27■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CLK1-211ENST00000481641 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CLK1-211ENST00000481641 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
CLK1-211ENST00000481641 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.26■■□□□ 1.47
CLK1-211ENST00000481641 COPS6Q7L5N1 327 aa24.26■■□□□ 1.47
CLK1-211ENST00000481641 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.26■■□□□ 1.47
CLK1-211ENST00000481641 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.26■■□□□ 1.47
CLK1-211ENST00000481641 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.26■■□□□ 1.47
CLK1-211ENST00000481641 WDR90Q96KV7 1748 aa24.26■■□□□ 1.47
CLK1-211ENST00000481641 SLC51AQ86UW1 340 aa24.25■■□□□ 1.47
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