RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
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RALGPS1-212ENST00000472427 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.91■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.91■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 MMP10P09238 476 aa27.9■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 PTGER2P43116 358 aa27.9■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 COPS6Q7L5N1 327 aa27.9■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF428Q96B54 188 aa27.9■■■□□ 2.06
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RALGPS1-212ENST00000472427 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
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RALGPS1-212ENST00000472427 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.81■■■□□ 2.04
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RALGPS1-212ENST00000472427 FLIIQ13045 1269 aa27.79■■■□□ 2.04
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RALGPS1-212ENST00000472427 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.72■■■□□ 2.03
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RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.64■■■□□ 2.02
RALGPS1-212ENST00000472427 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.64■■■□□ 2.02
RALGPS1-212ENST00000472427 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
RALGPS1-212ENST00000472427 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
RALGPS1-212ENST00000472427 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.64■■■□□ 2.02
RALGPS1-212ENST00000472427 NTSR2O95665 410 aa27.63■■■□□ 2.01
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