RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469065.1

SEMA4A-211, Transcript of semaphorin 4A, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA4A, Length 608 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4A-211ENST00000469065 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.74□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.74□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.74□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.74□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.74□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.74□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.74□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.73□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 MTHFSP49914 203 aa14.73□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.73□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 COL15A1P39059 1388 aa14.73□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 SRGNP10124 158 aa14.72□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.72□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 CNBD1Q8NA66 436 aa14.72□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.72□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 FYB1O15117 783 aa14.71□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 SETDB2Q96T68 719 aa14.71□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.71□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 NCAPD2Q15021 1401 aa14.71□□□□□ -0.05
SEMA4A-211ENST00000469065 TRPA1O75762 1119 aa14.7□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 TRAF5O00463 557 aa14.69□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 NPR1P16066 1061 aa14.69□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 ALDH1B1P30837 517 aa14.69□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 HUNKP57058 714 aa14.69□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.69□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.69□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 EYA1Q99502 592 aa14.69□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 STARD3NLO95772 234 aa14.68□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.68□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.68□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.68□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 RGMBQ6NW40 437 aa14.67□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 SYNE4Q8N205 404 aa14.67□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.67□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.67□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 RNF186Q9NXI6 227 aa14.67□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 PSMD1Q99460 953 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 EPS15P42566 896 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4A-211ENST00000469065 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 SCNN1DP51172 638 aa14.62□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 NIM1KQ8IY84 436 aa14.62□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.62□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.62□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.62□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 SLX4Q8IY92 1834 aa14.62□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 VPS33BQ9H267 617 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.58□□□□□ -0.07
SEMA4A-211ENST00000469065 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 CDCA8Q53HL2 280 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 H7C1D1 291 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 TJP1Q07157 1748 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 TNIP1Q15025 636 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 CSRNP1Q96S65 589 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 ZIC5Q96T25 663 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA4A-211ENST00000469065 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms