RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 USP16Q9Y5T5 823 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 MEGF6O75095 1541 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 DPEP1P16444 411 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 ERFEQ4G0M1 354 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 PARP10Q53GL7 1025 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 ANXA1P04083 346 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 GORABQ5T7V8 394 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 GLI3P10071 1580 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 CHRNA5P30532 468 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 C21orf2O43822 256 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 SLC4A2P04920 1241 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 NFIXQ14938 502 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 AKT1S1Q96B36 256 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 BACH2Q9BYV9 841 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 SLIT3O75094 1523 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 FAM161AQ3B820 660 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 KCNQ3O43525 872 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 MS4A1P11836 297 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC93Q567U6 631 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 NIM1KQ8IY84 436 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 MYD88Q99836 296 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 COL15A1P39059 1388 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 GYS1P13807 737 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 MASTLQ96GX5 879 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 ARID3AQ99856 593 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 DISP2A7MBM2 1401 aa7.41□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 CFAP44Q96MT7 982 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 EYA3Q99504 573 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-205ENST00000468371 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.4□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.4□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.4□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 BCL9O00512 1426 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 PPIP5K2O43314 1243 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 NPR1P16066 1061 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 IFT57Q9NWB7 429 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 OGFOD1Q8N543 542 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 LMNB1P20700 586 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 MPNDQ8N594 471 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 H7C1D1 291 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 COG6Q9Y2V7 657 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 RIMBP2O15034 1052 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 ERBB4Q15303 1308 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 E9PSI1 815 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-205ENST00000468371 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms