RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 C2CD2LO14523 706 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 POTEAQ6S8J7 498 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 NLRP8Q86W28 1048 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SVOPQ8N4V2 548 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 NGLY1Q96IV0 654 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 KANK3Q6NY19 840 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ACDQ96AP0 544 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 FGFR3P22607 806 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 STRN4Q9NRL3 753 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 PHF24Q9UPV7 400 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 CD33P20138 364 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 TNP2Q05952 138 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 GRIN2CQ14957 1233 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 IGFBP4P22692 258 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 WEE1P30291 646 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGEF15O94989 841 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 BMP4P12644 408 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 PRMT3O60678 531 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 ATG7O95352 703 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM157BP0CG42 384 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 MSTNO14793 375 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 EFSO43281 561 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 SUSD3Q96L08 255 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 SLAIN2Q9P270 581 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP2K3P46734 347 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-206ENST00000467748 BCRP11274 1271 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 OCLNQ16625 522 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 KLK14Q9P0G3 267 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 KLF15Q9UIH9 416 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 BCS1LQ9Y276 419 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP3K10Q02779 954 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 CEP63Q96MT8 703 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 MARK1Q9P0L2 795 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GGA1Q9UJY5 639 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 OIP5O43482 229 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 FOXO3O43524 673 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TYRO3Q06418 890 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 RTN1Q16799 776 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 BRD7Q9NPI1 651 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 CARNS1A5YM72 827 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 Q8N3U1 123 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC30A3Q99726 388 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ARID3AQ99856 593 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 DGKZQ13574 1117 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM182BQ5T319 152 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms