RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466852.1

VWA3B-211, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 4

Gene VWA3B, Length 570 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-211ENST00000466852 BACH2Q9BYV9 841 aa6.57□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 MED14O60244 1454 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 FLIIQ13045 1269 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 PDE3AQ14432 1141 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 NBPF14Q5TI25 921 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 AGLP35573 1532 aa6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 EVC2Q86UK5 1308 aa6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 GGT6Q6P531 493 aa6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 WDR63Q8IWG1 891 aa6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 CRBNQ96SW2 442 aa6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 APAF1O14727 1248 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 ADH1CP00326 375 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 MCM6Q14566 821 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 RUNDC1Q96C34 613 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 NR3C2P08235 984 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 FSHRP23945 695 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 MORC1Q86VD1 984 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 WWC1Q8IX03 1113 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 ZMYM3Q14202 1370 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 ABCC11Q96J66 1382 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 ADGRB2O60241 1585 aa6.52□□□□□ -1.36
VWA3B-211ENST00000466852 DLC1Q96QB1 1528 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 PLIN1O60240 522 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 IDI1Q13907 227 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 CFAP53Q96M91 514 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 SNRKQ9NRH2 765 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 RAPGEF3O95398 923 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 TIMP2P16035 220 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 GRM5P41594 1212 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 ERFEQ4G0M1 354 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 CDK15Q96Q40 435 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 PTPRMP28827 1452 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 IL16Q14005 1332 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 ZBTB33Q86T24 672 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 BANK1Q8NDB2 785 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 ITPKCQ96DU7 683 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 SIRT1Q96EB6 747 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 USP35Q9P2H5 1018 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 ALKQ9UM73 1620 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 DIP2BQ9P265 1576 aa6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 MTHFSP49914 203 aa6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 RAB15P59190 212 aa6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 MPNDQ8N594 471 aa6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-211ENST00000466852 NLRP1Q9C000 1473 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms