RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THSD4Q6ZMP0 1018 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZMYM3Q14202 1370 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO33Q7Z6M2 555 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL26A1Q96A83 441 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEPT3Q9UH03 358 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEP152O94986 1710 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCC3O15438 1527 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KDM5DQ9BY66 1539 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ROCK1Q13464 1354 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYCP01106 439 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL19A1Q14993 1142 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ECM1Q16610 540 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTRQ99707 1265 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MKNK1Q9BUB5 465 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LGR5O75473 907 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSPA2P54652 639 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGAP4P98171 946 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCL11AQ9H165 835 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAIPQ13075 1403 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MROH2AA6NES4 1674 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEPDC5O75140 1603 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL21Q9HBE4 155 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.27□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXO3O43524 673 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGFBP4P22692 258 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HELQQ8TDG4 1101 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF358Q9NW07 568 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KANK1Q14678 1352 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAPN12Q6ZSI9 719 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGL4Q8IZJ4 473 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GCC2Q8IWJ2 1684 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH3BP2P78314 561 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTMR3Q13615 1198 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TJAP1Q5JTD0 557 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUP155O75694 1391 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HFM1A2PYH4 1435 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PZPP20742 1482 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UNC13BO14795 1591 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VWDEQ8N2E2 1590 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM13AO94988 1023 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPR3P17342 541 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PREX1Q8TCU6 1659 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF516Q92618 1163 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPATQ14207 1427 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNRQ92752 1358 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM52Q96A61 297 aa12.23□□□□□ -0.45
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERVK-7P63135 1459 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM229AB2RXF0 380 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S1PR4O95977 384 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB15P59190 212 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C8orf37Q96NL8 207 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WASLO00401 505 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GAS2L2Q8NHY3 880 aa12.21□□□□□ -0.45
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LMTK2Q8IWU2 1503 aa12.21□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCTRP47872 440 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERVK-9P63128 1117 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBCK1Q9BYM8 510 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IQGAP3Q86VI3 1631 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERVH48-1M5A8F1 160 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RECKO95980 971 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TET3O43151 1660 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VARSP26640 1264 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VTI1AQ96AJ9 217 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.18□□□□□ -0.46
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