RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451506.5

PTPRN-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-209ENST00000451506 CFAP53Q96M91 514 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-209ENST00000451506 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-209ENST00000451506 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-209ENST00000451506 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 SLX4Q8IY92 1834 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 MASTLQ96GX5 879 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 PCNTO95613 3336 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 NPHP1O15259 732 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 SOGA3Q5TF21 947 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 MCM10Q7L590 875 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 NUDCQ9Y266 331 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 NBPF26B4DH59 902 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 PPP2R1AP30153 589 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 NBPF15Q8N660 670 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-209ENST00000451506 CACNA1SQ13698 1873 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 RGL2O15211 777 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 DCTN1Q14203 1278 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 CHADLQ6NUI6 762 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 POTEIP0CG38 1075 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 POTEJP0CG39 1038 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 NPR1P16066 1061 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 CCDC93Q567U6 631 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 TNS4Q8IZW8 715 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 CREBZFQ9NS37 354 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-209ENST00000451506 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 HLFQ16534 295 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 OLFM4Q6UX06 510 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 FAM177BA6PVY3 158 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 LDHDQ86WU2 507 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 PASKQ96RG2 1323 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 SCN4AP35499 1836 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 CAPN15O75808 1086 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 ALDH1B1P30837 517 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 SNED1Q8TER0 1413 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-209ENST00000451506 CRY2Q49AN0 593 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 CNTNAP1P78357 1384 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 ABCC12Q96J65 1359 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 FZD9O00144 591 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 SYNE4Q8N205 404 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 HACL1Q9UJ83 578 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 NGEFQ8N5V2 710 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 NYXQ9GZU5 481 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 EPHX2P34913 555 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 PSMD1Q99460 953 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRN-209ENST00000451506 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 GPC2Q8N158 579 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 NUP98P52948 1817 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 COL4A5P29400 1685 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 NEFMP07197 916 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.63■■□□□ 1.21
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