RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445150.3

SRP19-202, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP19, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-202ENST00000445150 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.62■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 COPS6Q7L5N1 327 aa22.61■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 NFIXQ14938 502 aa22.6■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.6■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 KLHL34Q8N239 644 aa22.6■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 VAMP4O75379 141 aa22.59■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.59■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.59■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.59■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.58■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 ANXA1P04083 346 aa22.58■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 PROSER3Q2NL68 480 aa22.58■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.58■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.58■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 SYT17Q9BSW7 474 aa22.58■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.58■■□□□ 1.21
SRP19-202ENST00000445150 NPHP1O15259 732 aa22.57■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 SERPINB2P05120 415 aa22.57■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.57■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 ZNF428Q96B54 188 aa22.57■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.57■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.56■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 SCN7AQ01118 1682 aa22.55■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 DDR1Q08345 913 aa22.55■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 HLFQ16534 295 aa22.55■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 SLC4A2P04920 1241 aa22.54■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 TGFB2P61812 414 aa22.54■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.54■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 NYXQ9GZU5 481 aa22.54■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 PARP10Q53GL7 1025 aa22.53■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.53■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.53■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.53■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.53■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 ST5P78524 1137 aa22.52■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SRP19-202ENST00000445150 BCORQ6W2J9 1755 aa22.51■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 ATP10DQ9P241 1426 aa22.51■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 TCIRG1Q13488 830 aa22.51■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.51■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 CNBD1Q8NA66 436 aa22.51■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.5■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.48■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 PDE6BP35913 854 aa22.48■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.48■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 GPTP24298 496 aa22.47■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.47■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 KSR2Q6VAB6 950 aa22.47■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.46■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 FLIIQ13045 1269 aa22.46■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.46■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.46■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SRP19-202ENST00000445150 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 FAM177BA6PVY3 158 aa22.44■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 H0YIN7 160 aa22.44■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.44■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.43■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 NLRP10Q86W26 655 aa22.43■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.43■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.43■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.43■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.43■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 SUSD4Q5VX71 490 aa22.42■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 NUP98P52948 1817 aa22.42■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.41■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 GPR162Q16538 588 aa22.41■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 G2E3Q7L622 706 aa22.41■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.41■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 MYD88Q99836 296 aa22.41■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 PIM2Q9P1W9 311 aa22.41■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 A0A0G2JLW4 131 aa22.4■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 DPEP1P16444 411 aa22.4■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.4■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 CACNA1FO60840 1977 aa22.39■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 PTPRCP08575 1304 aa22.39■■□□□ 1.18
SRP19-202ENST00000445150 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.39■■□□□ 1.17
SRP19-202ENST00000445150 NTSR2O95665 410 aa22.39■■□□□ 1.17
SRP19-202ENST00000445150 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SRP19-202ENST00000445150 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.39■■□□□ 1.17
SRP19-202ENST00000445150 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.39■■□□□ 1.17
SRP19-202ENST00000445150 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms