RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 TSPYL6Q8N831 410 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 TGFB2P61812 414 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 SETDB2Q96T68 719 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 ZNF521Q96K83 1311 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 A0A0G2JLW4 131 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 COPS6Q7L5N1 327 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 DPEP1P16444 411 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.854e-79■□□□□ 9.7
ACTB-206ENST00000443528 GPR162Q16538 588 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 KCNA3P22001 575 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-206ENST00000443528 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 ATP10DQ9P241 1426 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 CHRNA5P30532 468 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 CNBD1Q8NA66 436 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 HYPKQ9NX55 129 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 NUP98P52948 1817 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA2Q08379 1002 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 FAM177BA6PVY3 158 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 GPTP24298 496 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 VAMP4O75379 141 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-206ENST00000443528 UTRNP46939 3433 aa20.27■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 NPHP1O15259 732 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 GRIN3BO60391 1043 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 ST5P78524 1137 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 SUSD4Q5VX71 490 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 PIM2Q9P1W9 311 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 BCS1LQ9Y276 419 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 PDE6BP35913 854 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 TCIRG1Q13488 830 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 H0YIN7 160 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 NYXQ9GZU5 481 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 NTSR2O95665 410 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 SLFN5Q08AF3 891 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 PARP10Q53GL7 1025 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 STK31Q9BXU1 1019 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 ABCC12Q96J65 1359 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 E9PSI1 815 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 ERFEQ4G0M1 354 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 NLRP10Q86W26 655 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 SLC4A2P04920 1241 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 G2E3Q7L622 706 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-206ENST00000443528 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 SRGNP10124 158 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 TTLL6Q8N841 843 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms