RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ADCY2Q08462 1091 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 LONRF3Q496Y0 759 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP45Q9UL16 551 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CUL3Q13618 768 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CRYMQ14894 314 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ERBB4Q15303 1308 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 E2F5Q15329 346 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 BHMTQ93088 406 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA17Q96L03 361 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC160A6NGH7 325 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 NLRP5P59047 1200 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SNCBQ16143 134 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 BICD2Q8TD16 824 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 KRT38O76015 456 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ITM2BQ9Y287 266 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CETN3O15182 167 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SSFA2P28290 1259 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ABL2P42684 1182 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 RUFY3Q7L099 469 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM165Q9HC07 324 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 RAD50Q92878 1312 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MYO1BO43795 1136 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 FAM81BQ96LP2 452 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL33A6NCF5 533 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 LMNB1P20700 586 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 PSMD6Q15008 389 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 AP1G2O75843 785 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 OATP04181 439 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K7CLP57077 242 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ELF2Q15723 593 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ODF2Q5BJF6 829 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TMC6Q7Z403 805 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ATP2C2O75185 946 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CYP2C19P33261 490 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 POLE2P56282 527 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 GBP5Q96PP8 586 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 BATF3Q9NR55 127 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ERBB3P21860 1342 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TCP11Q8WWU5 503 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 EXOC4Q96A65 974 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SH3GL1Q99961 368 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MTA3Q9BTC8 594 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ABCF2Q9UG63 623 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 AKNAQ7Z591 1439 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC189A1A4V9 331 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ECEL1O95672 775 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MSL3P1P0C860 447 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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