RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440001.2

TRAF3IP2-AS1-203, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 915 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RIPK4P57078 832 aa36.25■■■■□ 3.39
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SLX4Q8IY92 1834 aa36.23■■■■□ 3.39
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa36.23■■■■□ 3.39
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NUP98P52948 1817 aa36.22■■■■□ 3.39
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TIAM2Q8IVF5 1701 aa36.2■■■■□ 3.38
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TSPYL4Q9UJ04 414 aa36.19■■■■□ 3.38
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LMOD3Q0VAK6 560 aa36.15■■■■□ 3.38
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TPTE2Q6XPS3 522 aa36.15■■■■□ 3.38
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TTLL7Q6ZT98 887 aa36.15■■■■□ 3.38
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CEP350Q5VT06 3117 aa36.13■■■■□ 3.37
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ERBB4Q15303 1308 aa36.12■■■■□ 3.37
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 MYL6BP14649 208 aa36.12■■■■□ 3.37
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FAM177BA6PVY3 158 aa36.11■■■■□ 3.37
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP36.1■■■■□ 3.37
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RUNDC1Q96C34 613 aa36.1■■■■□ 3.37
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RRAGCQ9HB90 399 aa36.09■■■■□ 3.37
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LRP10Q7Z4F1 713 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LTBP3Q9NS15 1303 aa36.08■■■■□ 3.37
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TAOK3Q9H2K8 898 aa36.04■■■■□ 3.36
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ZNF34Q8IZ26 560 aa36.01■■■■□ 3.36
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa35.96■■■■□ 3.35
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ALDH1B1P30837 517 aa35.93■■■■□ 3.34
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 POTECB2RU33 542 aa35.92■■■■□ 3.34
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DPY19L2Q6NUT2 758 aa35.92■■■■□ 3.34
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PARP10Q53GL7 1025 aa35.9■■■■□ 3.34
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SNED1Q8TER0 1413 aa35.9■■■■□ 3.34
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 COPS6Q7L5N1 327 aa35.89■■■■□ 3.34
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP35.89■■■■□ 3.34
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TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SMC1BQ8NDV3 1235 aa35.88■■■■□ 3.33
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 XAGE3Q8WTP9 111 aa35.88■■■■□ 3.33
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