RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.26□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBC1D9BQ66K14 1250 aa12.25□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WWC3Q9ULE0 1092 aa12.25□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POLD1P28340 1107 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IL16Q14005 1332 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHD4Q14839 1912 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NFIXQ14938 502 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HLFQ16534 295 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BICDL1Q6ZP65 573 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPEF2Q9C093 1822 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZPR1O75312 459 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC24Q8N4L8 307 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF428Q96B54 188 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MYH3P11055 1940 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COL4A1P02462 1669 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ABCC12Q96J65 1359 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 XAGE3Q8WTP9 111 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATP10DQ9P241 1426 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLX4Q8IY92 1834 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ERBB4Q15303 1308 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBN2Q6ZU65 1347 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A087WZG4 1122 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WDR63Q8IWG1 891 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HOXB7P09629 217 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TM4SF1P30408 202 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SYT17Q9BSW7 474 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM177BA6PVY3 158 aa12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPTP24298 496 aa12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 G2E3Q7L622 706 aa12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NLGN1Q8N2Q7 840 aa12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KIF6Q6ZMV9 814 aa12.18□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COPS6Q7L5N1 327 aa12.18□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PARP3Q9Y6F1 533 aa12.18□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SBF1O95248 1867 aa12.18□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADCY9O60503 1353 aa12.18□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SERPINB2P05120 415 aa12.17□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLFN5Q08AF3 891 aa12.17□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRR5LQ6MZQ0 368 aa12.17□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TIAM2Q8IVF5 1701 aa12.17□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa12.17□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A1B0GUL6 1792 aa12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VAMP4O75379 141 aa12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHRNA5P30532 468 aa12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GOLGA2Q08379 1002 aa12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC51AQ86UW1 340 aa12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.15□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A0G2JLW4 131 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 E9PSI1 815 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DPEP1P16444 411 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF652Q9Y2D9 606 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CD2APQ9Y5K6 639 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRRC37AA6NMS7 1700 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ERVV-1B6SEH8 477 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NTSR2O95665 410 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SUSD4Q5VX71 490 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF34Q8IZ26 560 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SYNE4Q8N205 404 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CNBD1Q8NA66 436 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SETDB2Q96T68 719 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCNA3P22001 575 aa12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLEC4GQ6UXB4 293 aa12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HYPKQ9NX55 129 aa12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZBED9Q6R2W3 1325 aa12.11□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FLIIQ13045 1269 aa12.11□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ERFEQ4G0M1 354 aa12.11□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NLRP10Q86W26 655 aa12.11□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLBD2Q8NHP8 589 aa12.11□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MYD88Q99836 296 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms