RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RGMBQ6NW40 437 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC102AQ96A19 550 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSRNP1Q96S65 589 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATG3Q9NT62 314 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CARMIL3Q8ND23 1372 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR153Q6NV75 609 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTC28Q96AY4 2481 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CENPFP49454 3210 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SERPINB2P05120 415 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPS15P42566 896 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCNN1DP51172 638 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NFIXQ14938 502 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF408Q9H9D4 720 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.56□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NBPF6Q5VWK0 638 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEFB123Q8N688 67 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NBPF4Q96M43 638 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNKSR1Q969H4 720 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USPL1Q5W0Q7 1092 aa12.55□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PGAP2Q9UHJ9 254 aa12.55□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MUC3AQ02505 3323 aa12.55□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC10A3P09131 477 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXC9P31274 260 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDE6BP35913 854 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NME9Q86XW9 330 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR25O00155 361 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZPR1O75312 459 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC93Q567U6 631 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTMR10Q9NXD2 777 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIEZO1Q92508 2521 aa12.53□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C7orf43Q8WVR3 580 aa12.53□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STAC3Q96MF2 364 aa12.53□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BRIP1Q9BX63 1249 aa12.53□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GJA3Q9Y6H8 435 aa12.53□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRKLP46109 303 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.52□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARMC5Q96C12 935 aa12.52□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBC1D8O95759 1140 aa12.52□□□□□ -0.41
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STYK1Q6J9G0 422 aa12.52□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.52□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDC37L1Q7L3B6 337 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.51□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF6P56537 245 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q7L0L9 218 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FKTNO75072 461 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM106CQ9BVX2 250 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP3K12Q12852 859 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCAF11Q8TEB1 546 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 JDP2Q8WYK2 163 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BCL2L12Q9HB09 334 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NARFQ9UHQ1 456 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM265A0A087WTH1 108 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AMPHP49418 695 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C2orf69Q8N8R5 385 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TJP1Q07157 1748 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRGNP10124 158 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RTKN2Q8IZC4 609 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MASTLQ96GX5 879 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPRC5DQ9NZD1 345 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM17Q9Y577 477 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RTL1A6NKG5 1358 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL4A5P29400 1685 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OTOP1Q7RTM1 612 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DPF3Q92784 378 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFHR5Q9BXR6 569 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EVC2Q86UK5 1308 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPTORQ8N122 1335 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TNFRSF10AO00220 468 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASAL3Q86YV0 1011 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRR5LQ6MZQ0 368 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP48Q86UV5 1035 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPG7Q9UQ90 795 aa12.43□□□□□ -0.42
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