RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429295.1

MRPL23-206, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL23, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23-206ENST00000429295 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 NBPF15Q8N660 670 aa28.83■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 SETDB2Q96T68 719 aa28.83■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 RRAGCQ9HB90 399 aa28.83■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 RUNDC1Q96C34 613 aa28.82■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.81■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.81■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 BCORQ6W2J9 1755 aa28.8■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 NPHP1O15259 732 aa28.8■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 LMNB1P20700 586 aa28.8■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 NEUROD2Q15784 382 aa28.8■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.8■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.8■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 FSTL1Q12841 308 aa28.78■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.78■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.78■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 PDE6BP35913 854 aa28.77■■■□□ 2.2
MRPL23-206ENST00000429295 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.76■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.76■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.76■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 RGL2O15211 777 aa28.75■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.75■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 CNBD1Q8NA66 436 aa28.75■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.74■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 ST5P78524 1137 aa28.73■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 NGEFQ8N5V2 710 aa28.73■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.72■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 GLTPD2A6NH11 291 aa28.71■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 SMC1BQ8NDV3 1235 aa28.71■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.71■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.7■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.7■■■□□ 2.19
MRPL23-206ENST00000429295 NFKBIEO00221 500 aa28.7■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 PRELPP51888 382 aa28.7■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 HTRA3P83110 453 aa28.7■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 C21orf2O43822 256 aa28.69■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 MYL6BP14649 208 aa28.69■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 SLX4Q8IY92 1834 aa28.69■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 ERBB4Q15303 1308 aa28.69■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.68■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 HLFQ16534 295 aa28.68■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.67■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.67■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 CHL1O00533 1208 aa28.66■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.66■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.65■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.65■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 CNKSR1Q969H4 720 aa28.65■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 KLRG1Q96E93 195 aa28.65■■■□□ 2.18
MRPL23-206ENST00000429295 ERFEQ4G0M1 354 aa28.63■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 FAM177BA6PVY3 158 aa28.62■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 APAF1O14727 1248 aa28.62■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 STYK1Q6J9G0 422 aa28.62■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.62■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 SRGNP10124 158 aa28.61■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 MASTLQ96GX5 879 aa28.61■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 PDIA6Q15084 440 aa28.6■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.6■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 SOGA3Q5TF21 947 aa28.59■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 CFAP44Q96MT7 982 aa28.59■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 NYXQ9GZU5 481 aa28.59■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 NECTIN2Q92692 538 aa28.58■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.58■■■□□ 2.17
MRPL23-206ENST00000429295 KRT24Q2M2I5 525 aa28.57■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.57■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 ANXA1P04083 346 aa28.56■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 PROSER3Q2NL68 480 aa28.56■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 CCDC184Q52MB2 194 aa28.56■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 PCNTO95613 3336 aa28.55■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 ANP32CO43423 234 aa28.55■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 NPR1P16066 1061 aa28.55■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 GPTP24298 496 aa28.55■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.54■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 JMYQ8N9B5 988 aa28.54■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 NUP98P52948 1817 aa28.54■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 HOXB7P09629 217 aa28.53■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 COPS6Q7L5N1 327 aa28.52■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.52■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 MBIPQ9NS73 344 aa28.52■■■□□ 2.16
MRPL23-206ENST00000429295 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.51■■■□□ 2.15
MRPL23-206ENST00000429295 POTECB2RU33 542 aa28.51■■■□□ 2.15
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF853P0CG23 659 aa28.51■■■□□ 2.15
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