RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427230.2

NANOGP4-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP4, Length 913 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP4-201ENST00000427230 BTG4Q9NY30 223 aa8.37□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.37□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 CASZ1Q86V15 1759 aa8.37□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.37□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.36□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.36□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.36□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 NRAPQ86VF7 1730 aa8.35□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 PTPRNQ16849 979 aa8.35□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.35□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.35□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.35□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 GPR162Q16538 588 aa8.34□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 MSS51Q4VC12 460 aa8.34□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 IL21Q9HBE4 155 aa8.34□□□□□ -1.07
NANOGP4-201ENST00000427230 KIF1BO60333 1816 aa8.33□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 ADH1BP00325 375 aa8.33□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.33□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa8.33□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 PNMA1Q8ND90 353 aa8.33□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.33□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.33□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.33□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 MMP16P51512 607 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 DLC1Q96QB1 1528 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 PCNTO95613 3336 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 HFM1A2PYH4 1435 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 KCNH2Q12809 1159 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 TNS4Q8IZW8 715 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 CLTCL1P53675 1640 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 ABCA3Q99758 1704 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 FBXO45P0C2W1 286 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 RFX1P22670 979 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 PSME1Q06323 249 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 SEMA3FQ13275 785 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 PDE3BQ13370 1112 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 PLSCR1O15162 318 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 S1PR4O95977 384 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 MTFR1LQ9H019 292 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 ALG2Q9H553 416 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 ROCK1Q13464 1354 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 MAP3K5Q99683 1374 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 SBNO1A3KN83 1393 aa8.28□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 ZBBXA8MT70 800 aa8.28□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 NR1H3Q13133 447 aa8.28□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 NAIPQ13075 1403 aa8.28□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 ATP10DQ9P241 1426 aa8.28□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 PPLO60437 1756 aa8.27□□□□□ -1.08
NANOGP4-201ENST00000427230 ARHGEF10O15013 1369 aa8.27□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 NUP155O75694 1391 aa8.27□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.27□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 ITGAEP38570 1179 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 HCSTQ9UBK5 93 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 KIF1AQ12756 1690 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC15A2Q16348 729 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 USP35Q9P2H5 1018 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 TECPR2O15040 1411 aa8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 SOX11P35716 441 aa8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 KCNC4Q03721 635 aa8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 PTK2Q05397 1052 aa8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 LINC01559Q495D7 138 aa8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 BAP1Q92560 729 aa8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 STRN4Q9NRL3 753 aa8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 STK32BQ9NY57 414 aa8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.24□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 GRIN3BO60391 1043 aa8.23□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 CDCA8Q53HL2 280 aa8.23□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.23□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.23□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.23□□□□□ -1.09
NANOGP4-201ENST00000427230 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.6 ms