RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

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Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.51■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.5■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 SPC24Q8NBT2 197 aa22.5■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.49■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.49■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.49■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 NECAB1Q8N987 351 aa22.48■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.48■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 NWD1Q149M9 1564 aa22.48■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 LTKP29376 864 aa22.48■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.48■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 ME3Q16798 604 aa22.47■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.47■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 PTPRUQ92729 1446 aa22.47■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 PIK3C2AO00443 1686 aa22.47■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 ANXA1P04083 346 aa22.47■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 HOXC9P31274 260 aa22.47■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.47■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 KIF3AQ9Y496 699 aa22.47■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.46■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 BEND3Q5T5X7 828 aa22.46■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 VPS53Q5VIR6 699 aa22.46■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.46■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.46■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 NLRP6P59044 892 aa22.46■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.46■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.46■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 TNRQ92752 1358 aa22.46■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.45■■□□□ 1.19
NEFHP1-201ENST00000412845 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.45■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.45■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 TTC6Q86TZ1 520 aa22.44■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.44■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.44■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 FERMT3Q86UX7 667 aa22.44■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.44■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 DIP2BQ9P265 1576 aa22.43■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 CAMK4Q16566 473 aa22.43■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.43■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.43■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNQ3O43525 872 aa22.43■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC192P0DO97 292 aa22.43■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 LIG1P18858 919 aa22.43■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 NECTIN1Q15223 517 aa22.42■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.42■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.42■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNB2Q92953 911 aa22.42■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.42■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 CBX1P83916 185 aa22.41■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 ATP2B3Q16720 1220 aa22.41■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.41■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.41■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 LGR6Q9HBX8 967 aa22.41■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 LUZP1Q86V48 1076 aa22.4■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.4■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.4■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.4■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 PTGS1P23219 599 aa22.4■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM227BQ96M60 508 aa22.4■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.4■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 ADCY9O60503 1353 aa22.39■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.39■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.39■■□□□ 1.18
NEFHP1-201ENST00000412845 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.39■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.39■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 TYRO3Q06418 890 aa22.38■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.38■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP3K11Q16584 847 aa22.38■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.38■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 KRT85P78386 507 aa22.37■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.37■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.37■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 TPM3P06753 285 aa22.36■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 KLHL34Q8N239 644 aa22.36■■□□□ 1.17
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