RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.13□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUP98P52948 1817 aa11.12□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.12□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBPF26B4DH59 902 aa11.12□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBTB22O15209 634 aa11.12□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDR1Q08345 913 aa11.12□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR162Q16538 588 aa11.12□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBPF15Q8N660 670 aa11.12□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.12□□□□□ -0.63
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.12□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.11□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDR63Q8IWG1 891 aa11.11□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WWC1Q8IX03 1113 aa11.11□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MBIPQ9NS73 344 aa11.11□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa11.11□□□□□ -0.63
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.1□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.1□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SERPINB2P05120 415 aa11.1□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.1□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa11.1□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NYXQ9GZU5 481 aa11.1□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDE6BP35913 854 aa11.09□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ST5P78524 1137 aa11.09□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.09□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CNBD1Q8NA66 436 aa11.09□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.09□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HYPKQ9NX55 129 aa11.09□□□□□ -0.63
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPHP1O15259 732 aa11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAPN15O75808 1086 aa11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PARP10Q53GL7 1025 aa11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIM2Q9P1W9 311 aa11.08□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UTRNP46939 3433 aa11.07□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYL6BP14649 208 aa11.07□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDIA6Q15084 440 aa11.07□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.07□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.07□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYH16Q9H6N6 1097 aa11.07□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H0YIN7 160 aa11.06□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.06□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DPEP1P16444 411 aa11.05□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DSG3P32926 999 aa11.05□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.05□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STK31Q9BXU1 1019 aa11.05□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHPF2Q9P2E5 772 aa11.05□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 YY1P25490 414 aa11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GOLGA2Q08379 1002 aa11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SOGA3Q5TF21 947 aa11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COPS6Q7L5N1 327 aa11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF521Q96K83 1311 aa11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.04□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A0G2JLW4 131 aa11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNA3P22001 575 aa11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HLFQ16534 295 aa11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRT24Q2M2I5 525 aa11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PROSER3Q2NL68 480 aa11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STYK1Q6J9G0 422 aa11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTLL6Q8N841 843 aa11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CNKSR1Q969H4 720 aa11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BCS1LQ9Y276 419 aa11.03□□□□□ -0.64
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 E9PSI1 815 aa11.02□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.02□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF428Q96B54 188 aa11.02□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MASTLQ96GX5 879 aa11.02□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
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