RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PMS1-205ENST00000409985 ATRNO75882 1429 aa28.95■■■□□ 2.23
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.95■■■□□ 2.23
PMS1-205ENST00000409985 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.95■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 GLI3P10071 1580 aa28.94■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.94■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 CUL4AQ13619 759 aa28.94■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.93■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.93■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 DISP2A7MBM2 1401 aa28.93■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 ADCY9O60503 1353 aa28.93■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 RILPL2Q969X0 211 aa28.92■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 SRGAP3O43295 1099 aa28.91■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 NEK4P51957 841 aa28.91■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.91■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.91■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.9■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
PMS1-205ENST00000409985 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.89■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.89■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 TMX3Q96JJ7 454 aa28.89■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 ANO2Q9NQ90 1003 aa28.89■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 HYPKQ9NX55 129 aa28.89■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 KCNQ3O43525 872 aa28.88■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 KSR2Q6VAB6 950 aa28.88■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 AK9Q5TCS8 1911 aa28.88■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 IL2RBP14784 551 aa28.87■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 HSPA4P34932 840 aa28.87■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.87■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.86■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 CNTROBQ8N137 903 aa28.86■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.86■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 LMBRD1Q9NUN5 540 aa28.86■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.85■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 UTYO14607 1347 aa28.85■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 ZNF445P59923 1031 aa28.85■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 BARGINQ6ZT62 677 aa28.85■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 PANK2Q9BZ23 570 aa28.85■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.84■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 SGSM2O43147 1006 aa28.83■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 MCTP1Q6DN14 999 aa28.83■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC9Q9Y397 364 aa28.83■■■□□ 2.21
PMS1-205ENST00000409985 POTEAQ6S8J7 498 aa28.83■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 GAS2L3Q86XJ1 694 aa28.83■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.83■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 PALD1Q9ULE6 856 aa28.83■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.28e-9■■□□□ 11.4
PMS1-205ENST00000409985 RAD50Q92878 1312 aa28.82■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 LINS1Q8NG48 757 aa28.81■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.81■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.8■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 EP400Q96L91 3159 aa28.8■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 CYP27B1O15528 508 aa28.79■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 BRD1O95696 1058 aa28.79■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 PKP1Q13835 747 aa28.78■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 GPATCH3Q96I76 525 aa28.78■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.77■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.77■■■□□ 2.2
PMS1-205ENST00000409985 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.75■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 ARXQ96QS3 562 aa28.74■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 TNS2Q63HR2 1409 aa28.74■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 GRM8O00222 908 aa28.73■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 MBD3O95983 291 aa28.73■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 ANXA1P04083 346 aa28.73■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.73■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 CLCN1P35523 988 aa28.72■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 SPG7Q9UQ90 795 aa28.72■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 PHKG2P15735 406 aa28.72■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 CCDC173Q0VFZ6 552 aa28.72■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 PROSER3Q2NL68 480 aa28.72■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R9BQ96SB3 815 aa28.72■■■□□ 2.19
PMS1-205ENST00000409985 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
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