RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.18□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.18□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.17□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 IRS1P35568 1242 aa10.17□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 POU4F2Q12837 409 aa10.17□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 DBN1Q16643 649 aa10.17□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa10.17□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 NBPF15Q8N660 670 aa10.17□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 HRH3Q9Y5N1 445 aa10.17□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 KIF14Q15058 1648 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 GNRH1P01148 92 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 SLC27A3Q5K4L6 730 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 VPS8Q8N3P4 1428 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 LYPD4Q6UWN0 246 aa10.15□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 MBIPQ9NS73 344 aa10.15□□□□□ -0.78
CCL20-202ENST00000409189 IL2RAP01589 272 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 IRF5Q13568 498 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 PHTF2Q8N3S3 785 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 H7C1W4 665 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 WASLO00401 505 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 TAS1R3Q7RTX0 852 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 CNKSR1Q969H4 720 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 RAB6BQ9NRW1 208 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.11□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 GPR25O00155 361 aa10.11□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 MSTNO14793 375 aa10.11□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 FOXR1Q6PIV2 292 aa10.11□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 XAGE2Q96GT9 111 aa10.11□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 MYCP01106 439 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 THBS1P07996 1170 aa10.1□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 CENPCQ03188 943 aa10.1□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa10.1□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 ABCC1P33527 1531 aa10.1□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.09□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 F11P03951 625 aa10.09□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
CCL20-202ENST00000409189 MARSP56192 900 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa10.08□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 MAP3K10Q02779 954 aa10.07□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 TSGA10IPQ3SY00 556 aa10.07□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 PRM3Q9NNZ6 103 aa10.07□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.07□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 MED14O60244 1454 aa10.06□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 TRERF1Q96PN7 1200 aa10.06□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.06□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.05□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GTH6 734 aa10.05□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 Q8N3U1 123 aa10.05□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 ACDQ96AP0 544 aa10.05□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 SYNMO15061 1565 aa10.05□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 PLXNC1O60486 1568 aa10.05□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 IQGAP1P46940 1657 aa10.04□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 BCRP11274 1271 aa10.04□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 USP4Q13107 963 aa10.04□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.04□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 GGT6Q6P531 493 aa10.04□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.04□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 ENAMQ9NRM1 1142 aa10.04□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 DEPDC5O75140 1603 aa10.04□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 LBRQ14739 615 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.03□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 FAM135BQ49AJ0 1406 aa10.03□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 C4orf17Q53FE4 359 aa10.03□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 RNF135Q8IUD6 432 aa10.03□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 CFHR5Q9BXR6 569 aa10.03□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 ETNK1Q9HBU6 452 aa10.03□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 PREX2Q70Z35 1606 aa10.03□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 MAP3K1Q13233 1512 aa10.02□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 TNRQ92752 1358 aa10.02□□□□□ -0.8
CCL20-202ENST00000409189 MX2P20592 715 aa10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms