RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 CNBD1Q8NA66 436 aa40.08■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 NECTIN2Q92692 538 aa40.08■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 KIF6Q6ZMV9 814 aa40.07■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 TTLL7Q6ZT98 887 aa40.07■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 C2CD5Q86YS7 1000 aa40.06■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa40.05■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 RGL2O15211 777 aa40.05■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 MBIPQ9NS73 344 aa40.05■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa40.04■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa40.04■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 DLEC1Q9Y238 1755 aa40.02■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 ERVV-1B6SEH8 477 aa40.02■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 ANXA1P04083 346 aa40.02■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 ST5P78524 1137 aa40.02■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 PDIA6Q15084 440 aa40.02■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 PROSER3Q2NL68 480 aa40.02■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa40.02■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 BRIP1Q9BX63 1249 aa40.02■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 ZBTB3Q9H5J0 574 aa40.02■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 IFT57Q9NWB7 429 aa40.02■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 H0YIN7 160 aa40.01■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF853P0CG23 659 aa40.01■■■■■ 4
CMTM4-202ENST00000394106 NUP98P52948 1817 aa40■■■■□ 3.99
CMTM4-202ENST00000394106 FAM177BA6PVY3 158 aa40■■■■□ 3.99
CMTM4-202ENST00000394106 PDE6BP35913 854 aa40■■■■□ 3.99
CMTM4-202ENST00000394106 GNAI1P63096 354 aa40■■■■□ 3.99
CMTM4-202ENST00000394106 LRP10Q7Z4F1 713 aa39.97■■■■□ 3.99
CMTM4-202ENST00000394106 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
CMTM4-202ENST00000394106 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa39.95■■■■□ 3.99
CMTM4-202ENST00000394106 DUSP27Q5VZP5 1158 aa39.95■■■■□ 3.99
CMTM4-202ENST00000394106 HOXB7P09629 217 aa39.94■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 TPTE2Q6XPS3 522 aa39.94■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 TTLL6Q8N841 843 aa39.94■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP39.94■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP39.93■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa39.93■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 ATP10DQ9P241 1426 aa39.92■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 CHPF2Q9P2E5 772 aa39.92■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 GPTP24298 496 aa39.91■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC27Q2M243 656 aa39.91■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 FAM9BQ8IZU0 186 aa39.91■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 COPS6Q7L5N1 327 aa39.9■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 XAGE3Q8WTP9 111 aa39.9■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 WWC1Q8IX03 1113 aa39.89■■■■□ 3.98
CMTM4-202ENST00000394106 ADCY9O60503 1353 aa39.87■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 NYXQ9GZU5 481 aa39.86■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 UBN2Q6ZU65 1347 aa39.86■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF34Q8IZ26 560 aa39.85■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 SRGNP10124 158 aa39.84■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 NUTM1Q86Y26 1132 aa39.83■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 SUSD4Q5VX71 490 aa39.82■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 STYK1Q6J9G0 422 aa39.82■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 C8orf58Q8NAV2 365 aa39.82■■■■□ 3.97
CMTM4-202ENST00000394106 CACNA1SQ13698 1873 aa39.81■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 MASTLQ96GX5 879 aa39.81■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 ERFEQ4G0M1 354 aa39.79■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 CNKSR1Q969H4 720 aa39.79■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 ABCC12Q96J65 1359 aa39.79■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 C9orf131Q5VYM1 1079 aa39.78■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 HYPKQ9NX55 129 aa39.78■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa39.77■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 PARP10Q53GL7 1025 aa39.77■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 C21orf2O43822 256 aa39.76■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 RASSF7Q02833 373 aa39.76■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa39.76■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa39.76■■■■□ 3.96
CMTM4-202ENST00000394106 SLX4Q8IY92 1834 aa39.75■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 IL16Q14005 1332 aa39.75■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 NTSR2O95665 410 aa39.75■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 NPR1P16066 1061 aa39.75■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 TSPYL6Q8N831 410 aa39.74■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 RNF181Q9P0P0 153 aa39.74■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa39.73■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 SBF1O95248 1867 aa39.73■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 TCIRG1Q13488 830 aa39.72■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa39.72■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 PLBD2Q8NHP8 589 aa39.72■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC30Q5VVM6 783 aa39.69■■■■□ 3.94
CMTM4-202ENST00000394106 WDR63Q8IWG1 891 aa39.69■■■■□ 3.94
CMTM4-202ENST00000394106 NLRP10Q86W26 655 aa39.68■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms